90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6338 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  77.88 
 
 		 951 aa  1529    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 957 aa  1988    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.44 
 
 		 1286 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.8 
 
 		 1084 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.5 
 
 		 1193 aa  341  4e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.25 
 
 		 1181 aa  195  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.82 
 
 		 1274 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.71 
 
 		 1162 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.22 
 
 		 1265 aa  184  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.27 
 
 		 705 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.57 
 
 		 1149 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.26 
 
 		 1068 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.95 
 
 		 1180 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.76 
 
 		 1055 aa  158  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.28 
 
 		 1171 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.69 
 
 		 712 aa  154  8.999999999999999e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.49 
 
 		 1306 aa  152  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.93 
 
 		 1503 aa  145  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  25.64 
 
 		 1139 aa  133  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.6 
 
 		 1390 aa  105  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.37 
 
 		 1040 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.23 
 
 		 749 aa  101  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.45 
 
 		 1027 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.76 
 
 		 762 aa  98.2  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.33 
 
 		 868 aa  97.8  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.96 
 
 		 759 aa  94.7  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.24 
 
 		 1023 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.59 
 
 		 852 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.42 
 
 		 968 aa  92  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.47 
 
 		 1201 aa  82  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  24.22 
 
 		 1058 aa  82  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  40.77 
 
 		 466 aa  77.8  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.65 
 
 		 436 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  26.99 
 
 		 1110 aa  77  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  32.45 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.44 
 
 		 773 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0223  Levanase  36.03 
 
 		 738 aa  69.3  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.060447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  22.36 
 
 		 756 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.3 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.76 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  22.8 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  26.8 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  24.21 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  30.46 
 
 		 447 aa  56.6  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  23.4 
 
 		 396 aa  55.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  26.32 
 
 		 398 aa  55.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  24.21 
 
 		 446 aa  55.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  27.32 
 
 		 448 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3991  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1217 aa  54.7  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373795  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  26.97 
 
 		 423 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.77 
 
 		 864 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  27.32 
 
 		 448 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  27.54 
 
 		 1439 aa  52.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2506  hypothetical protein  35.87 
 
 		 738 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  29.73 
 
 		 448 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  24.68 
 
 		 381 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  26.18 
 
 		 442 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  25.64 
 
 		 514 aa  50.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  24.5 
 
 		 446 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.6 
 
 		 433 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  26.04 
 
 		 438 aa  49.3  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  27.05 
 
 		 430 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.92 
 
 		 362 aa  48.5  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  25.26 
 
 		 451 aa  48.5  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  26.09 
 
 		 430 aa  48.5  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  23.04 
 
 		 874 aa  48.5  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  25.69 
 
 		 880 aa  48.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  22.37 
 
 		 423 aa  47.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  23.23 
 
 		 410 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  27.18 
 
 		 430 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7034  levanase  33.57 
 
 		 681 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00232409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  29.34 
 
 		 454 aa  47  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1319  levanase  28.37 
 
 		 705 aa  47  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00921692  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  28.73 
 
 		 1142 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  26.09 
 
 		 430 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2740  hypothetical protein  37.14 
 
 		 478 aa  46.2  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  22.22 
 
 		 371 aa  45.8  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  22.82 
 
 		 421 aa  45.8  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  21.64 
 
 		 420 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  24.7 
 
 		 446 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  27.03 
 
 		 314 aa  45.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  25.16 
 
 		 363 aa  45.4  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25 
 
 		 391 aa  45.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.95 
 
 		 391 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.95 
 
 		 391 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  23.83 
 
 		 371 aa  45.1  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  25.36 
 
 		 473 aa  45.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  24.51 
 
 		 377 aa  45.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  24.38 
 
 		 437 aa  44.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.61 
 
 		 361 aa  44.7  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>