More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1262 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  82.76 
 
 		 1055 aa  1800    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1068 aa  2219    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.95 
 
 		 1306 aa  646    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  38.01 
 
 		 1139 aa  568  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.82 
 
 		 1390 aa  502  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.53 
 
 		 1162 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.48 
 
 		 1149 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.95 
 
 		 1181 aa  333  8e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.98 
 
 		 1180 aa  198  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.66 
 
 		 1286 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  25.82 
 
 		 756 aa  188  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.14 
 
 		 1274 aa  188  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.35 
 
 		 1265 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.29 
 
 		 951 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.35 
 
 		 957 aa  173  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.35 
 
 		 1193 aa  168  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.73 
 
 		 1171 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29 
 
 		 1040 aa  165  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.87 
 
 		 759 aa  164  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.93 
 
 		 762 aa  162  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.09 
 
 		 705 aa  154  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.23 
 
 		 1503 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.99 
 
 		 749 aa  150  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.65 
 
 		 1084 aa  144  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.77 
 
 		 773 aa  144  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.16 
 
 		 1027 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.26 
 
 		 868 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.02 
 
 		 712 aa  109  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  50.46 
 
 		 577 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  51.4 
 
 		 587 aa  103  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.25 
 
 		 601 aa  99  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26 
 
 		 852 aa  99  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.66 
 
 		 1023 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  40 
 
 		 161 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.39 
 
 		 968 aa  95.5  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  47.47 
 
 		 189 aa  94  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  26.42 
 
 		 1110 aa  92  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  48 
 
 		 202 aa  92  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  43.52 
 
 		 203 aa  91.7  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 202 aa  91.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  43.36 
 
 		 149 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  41.8 
 
 		 222 aa  89  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.42 
 
 		 1201 aa  87.8  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  47.27 
 
 		 217 aa  87  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  46.3 
 
 		 142 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  41.23 
 
 		 197 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  40.16 
 
 		 205 aa  87  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  45.87 
 
 		 147 aa  84.7  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  42.06 
 
 		 548 aa  83.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  32.26 
 
 		 1058 aa  81.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  37.7 
 
 		 202 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  42.48 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  35.19 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 864 aa  75.1  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.94 
 
 		 537 aa  74.7  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  41.07 
 
 		 268 aa  74.3  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  38.58 
 
 		 499 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  38.58 
 
 		 499 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  43.56 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  35.26 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  37.01 
 
 		 510 aa  72.8  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.61 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  35.33 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.71 
 
 		 530 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.89 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 427 aa  72  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  40.71 
 
 		 554 aa  72  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  40.87 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 523 aa  70.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 151 aa  70.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.87 
 
 		 432 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  40.87 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  40.87 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  40.86 
 
 		 150 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  40.87 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  40.87 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  40.87 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  41.59 
 
 		 438 aa  70.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  40.87 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  40.87 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  37.96 
 
 		 516 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.35 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.14 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  40 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.45 
 
 		 447 aa  69.7  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  40 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  35.34 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  38.94 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.06 
 
 		 575 aa  68.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  35.33 
 
 		 712 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0665  hypothetical protein  23.19 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.78 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  33.53 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.84 
 
 		 469 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  39.82 
 
 		 429 aa  67.4  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.28 
 
 		 450 aa  67.4  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>