More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1432 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  40.33 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  37.97 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  40.33 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  51.82 
 
 		 197 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  38.27 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  36 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  45.97 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  44.26 
 
 		 499 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  44.26 
 
 		 499 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  43.44 
 
 		 510 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  37.16 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  39.26 
 
 		 479 aa  98.6  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  43.4 
 
 		 516 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  44.23 
 
 		 520 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  44.23 
 
 		 516 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  44.23 
 
 		 520 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  43.27 
 
 		 520 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  43.27 
 
 		 520 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  43.27 
 
 		 520 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  43.27 
 
 		 520 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  39.69 
 
 		 151 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  42.03 
 
 		 161 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  41.73 
 
 		 147 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  47.31 
 
 		 577 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  41.54 
 
 		 158 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  49.07 
 
 		 268 aa  89.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.18 
 
 		 601 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  47.27 
 
 		 1068 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.01 
 
 		 762 aa  85.5  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  45.74 
 
 		 150 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  41.53 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  35.88 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  43.14 
 
 		 587 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.1 
 
 		 759 aa  82  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  40.78 
 
 		 147 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.21 
 
 		 773 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  35.85 
 
 		 136 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  41.75 
 
 		 142 aa  81.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.48 
 
 		 852 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  39.05 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  39.42 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  38.28 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  44.34 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  44.55 
 
 		 1055 aa  75.9  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  36.21 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  28.68 
 
 		 407 aa  75.9  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  43.36 
 
 		 424 aa  75.9  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.36 
 
 		 424 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  42.55 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.81 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  36.54 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  38.24 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  32.28 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  30.3 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  40.68 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.39 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.5 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  40.34 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  41.05 
 
 		 775 aa  72.8  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.12 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.37 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  35.34 
 
 		 675 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.77 
 
 		 749 aa  72  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 475 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  40 
 
 		 475 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  42.31 
 
 		 434 aa  72  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.83 
 
 		 469 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  40 
 
 		 475 aa  72  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 437 aa  71.6  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.05 
 
 		 426 aa  71.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  39.02 
 
 		 450 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  40.57 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.41 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.01 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  37.62 
 
 		 521 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  39.5 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  37.96 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  38.38 
 
 		 528 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  42.45 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.92 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1130  putative cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  32.76 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  36.27 
 
 		 520 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  39.36 
 
 		 335 aa  68.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  38.68 
 
 		 439 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 463 aa  68.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  36.08 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  41.05 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  34.15 
 
 		 669 aa  68.6  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  39.18 
 
 		 513 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  36.89 
 
 		 390 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.82 
 
 		 531 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  37.86 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  42.22 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  38.3 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  33.08 
 
 		 756 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>