More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2107 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  97.69 
 
 
516 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  99.62 
 
 
520 aa  1048    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  70.06 
 
 
510 aa  758    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  99.62 
 
 
520 aa  1048    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  99.81 
 
 
520 aa  1050    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  69.1 
 
 
499 aa  743    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  94.23 
 
 
516 aa  935    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  99.62 
 
 
520 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  100 
 
 
520 aa  1053    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  69.1 
 
 
499 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  99.62 
 
 
520 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  57.3 
 
 
479 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  56.47 
 
 
481 aa  510  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1796  nitrite reductase, copper-containing  48.69 
 
 
348 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00424702  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  56.7 
 
 
534 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1009  nitrite reductase, copper-containing  47.04 
 
 
350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1326  nitrite reductase, copper-containing  50.82 
 
 
466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.852268  normal  0.995257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1208  nitrite reductase, copper-containing  45.13 
 
 
355 aa  280  6e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  46.27 
 
 
451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1108  nitrite reductase, copper-containing  48.22 
 
 
358 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0035  nitrite reductase, copper-containing  46.33 
 
 
362 aa  261  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1016  nitrite reductase, copper-containing  44.75 
 
 
364 aa  257  4e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.552057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3087  nitrite reductase, copper-containing  42.76 
 
 
352 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3335  nitrite reductase, copper-containing  37.57 
 
 
392 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2681  nitrite reductase (NO-forming)  36.99 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0944  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.14 
 
 
487 aa  181  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  35.69 
 
 
463 aa  179  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3482  nitrite reductase, copper containing  36 
 
 
391 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2061  multicopper oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 
535 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429703  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1019  nitrite reductase (NO-forming)  37.98 
 
 
526 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0477  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.74 
 
 
487 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0798  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.74 
 
 
535 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1613  multicopper oxidase domain-containing protein  35.74 
 
 
535 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0659  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.74 
 
 
535 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870882  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0548  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.74 
 
 
487 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181487  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1966  multicopper oxidase domain-containing protein  35.4 
 
 
535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.328521  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  38.24 
 
 
479 aa  162  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2243  nitrite reductase, copper-containing  35.78 
 
 
367 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4623  nitrite reductase, copper-containing  36.7 
 
 
370 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1768  Nitrite reductase (NO-forming)  38.26 
 
 
876 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0968219  decreased coverage  0.0045264 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0236  nitrite reductase, copper-containing  37.74 
 
 
376 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3489  multicopper oxidase, type 3  37.17 
 
 
857 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.0660618 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6278  nitrite reductase, copper-containing  35.03 
 
 
376 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  0.19336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  34.01 
 
 
307 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4752  Nitrite reductase (NO-forming)  35.93 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6826  copper-containing nitrite reductase (NO-forming) nirK  35.26 
 
 
364 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0089  nitrite reductase (NO-forming)  33.97 
 
 
372 aa  148  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2351  nitrite reductase  36.68 
 
 
912 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.76545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2101  multicopper oxidase, type 3  33.7 
 
 
911 aa  147  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1595  nitrite reductase, copper-containing  35.18 
 
 
374 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0260  copper-containing nitrite reductase  37.74 
 
 
376 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3727  nitrite reductase, copper-containing  36.59 
 
 
369 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4379  nitrite reductase, copper-containing  38.99 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2648  multicopper oxidase  30.98 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3281  multicopper oxidase, type 3  32.38 
 
 
316 aa  140  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.181317  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  33.99 
 
 
471 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1417  multicopper oxidase type 3  32.18 
 
 
314 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4273  nitrite reductase, copper-containing  33.87 
 
 
366 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  34.66 
 
 
856 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0150  Nitrite reductase (NO-forming)  33.09 
 
 
952 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.684511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4252  Nitrite reductase (NO-forming)  33.83 
 
 
878 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.622613  normal  0.180427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  32.23 
 
 
526 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09060  predicted multicopper oxidase  33.09 
 
 
969 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  30.58 
 
 
486 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  52.43 
 
 
202 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  49.49 
 
 
203 aa  104  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  43.52 
 
 
202 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  49.49 
 
 
202 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2511  multicopper oxidase, type 3  26.79 
 
 
293 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00579899  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0083  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 
338 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00000323423  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  42.73 
 
 
217 aa  97.8  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  46.53 
 
 
268 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  27.7 
 
 
444 aa  94.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  38.61 
 
 
205 aa  94  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  48 
 
 
197 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  38.28 
 
 
150 aa  94  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  39.13 
 
 
222 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.16 
 
 
601 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.84 
 
 
762 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  43.62 
 
 
136 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1259  hypothetical protein  27.42 
 
 
470 aa  90.1  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  37.86 
 
 
577 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4419  multicopper oxidase  28.4 
 
 
376 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.768242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  39.05 
 
 
147 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  44.04 
 
 
158 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  39.22 
 
 
142 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  42.5 
 
 
147 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  40.17 
 
 
151 aa  87  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  42.24 
 
 
146 aa  86.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  25.73 
 
 
527 aa  86.7  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  42.34 
 
 
159 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  42.37 
 
 
152 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1784  multicopper oxidase type 3  24.33 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1663  multicopper oxidase type 3  25.83 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1447  multicopper oxidase type 3  26.74 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1473  multicopper oxidase type 3  26.74 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1667  hypothetical protein  27.27 
 
 
470 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  40.16 
 
 
675 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  34.21 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2574  multicopper oxidase type 3  28.19 
 
 
355 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>