96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1689 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  100 
 
 		 152 aa  294  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  61.69 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  63.43 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  40 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  43.97 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  41.48 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  39.69 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  46.02 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  38.97 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  44.94 
 
 		 151 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  38.46 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  39.05 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  44.16 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  41.94 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  40.66 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  42.35 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 202 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  38.04 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  35.96 
 
 		 481 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  33.9 
 
 		 577 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  38.82 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  45.98 
 
 		 516 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  44.83 
 
 		 520 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  44.83 
 
 		 520 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  44.83 
 
 		 520 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  44.83 
 
 		 516 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  44.83 
 
 		 520 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  44.83 
 
 		 520 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  44.83 
 
 		 520 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  39.56 
 
 		 499 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  39.56 
 
 		 499 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  38.46 
 
 		 510 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  38.79 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  32 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  37.17 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  32.35 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  33.93 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  37.17 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  37.17 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  36.22 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  32.91 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  37.17 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 182 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  30.46 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.73 
 
 		 1055 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.94 
 
 		 601 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  36.08 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  38.16 
 
 		 274 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  35.4 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  35.07 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  36.14 
 
 		 587 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  33.61 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  33.61 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  34.91 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  30.97 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  33.61 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  35.92 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  35.79 
 
 		 335 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  33.62 
 
 		 113 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 427 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.8 
 
 		 749 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  32.32 
 
 		 338 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.86 
 
 		 425 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.91 
 
 		 1068 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  32.94 
 
 		 775 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.04 
 
 		 433 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 432 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.28 
 
 		 474 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.91 
 
 		 432 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 432 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 268 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.63 
 
 		 759 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.91 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 432 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  38.71 
 
 		 438 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  34.48 
 
 		 473 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 432 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 440 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  31.17 
 
 		 147 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30 
 
 		 432 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  42.11 
 
 		 511 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  34.78 
 
 		 429 aa  41.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  31.53 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 432 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.41 
 
 		 440 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.29 
 
 		 447 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>