43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5227 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  100 
 
 		 178 aa  357  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  93.82 
 
 		 178 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  93.82 
 
 		 178 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  81.98 
 
 		 182 aa  270  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  83.73 
 
 		 182 aa  270  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  85.12 
 
 		 181 aa  257  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  80.41 
 
 		 183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  94.69 
 
 		 113 aa  222  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  48.03 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  38.14 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  37.19 
 
 		 149 aa  90.5  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  39.13 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  34.97 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  37.24 
 
 		 161 aa  84.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  38.26 
 
 		 157 aa  84.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  34.72 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  35.07 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  32.8 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  32.89 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  35.19 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  35.85 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  31.45 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  31.2 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  34.45 
 
 		 156 aa  50.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  33.61 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  26.62 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  30.82 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  28.77 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  29.45 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  30.4 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  30.4 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  30.28 
 
 		 115 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  28.81 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  35.79 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>