23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2220 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  349  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  44.7 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  45.26 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  36.2 
 
 		 183 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  40.87 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  40.87 
 
 		 181 aa  88.2  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  40 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  40 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  39.53 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  40 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 178 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  37.38 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  40.52 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 113 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  39.37 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  40.17 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  31.4 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  32.48 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  29.01 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  29.46 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  33.09 
 
 		 415 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  31.88 
 
 		 415 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>