More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0431 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  55.65 
 
 		 146 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  53.68 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  58.12 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  50.39 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  50.41 
 
 		 151 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  45.53 
 
 		 150 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  43.44 
 
 		 152 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  38.35 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  33.76 
 
 		 510 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  38.33 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  36.76 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  36.6 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  37.59 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  37.93 
 
 		 499 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  37.93 
 
 		 499 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  38.14 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  38.14 
 
 		 166 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  40.2 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  43.16 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  37.86 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  39.05 
 
 		 152 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  34.45 
 
 		 149 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  38.14 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  38.14 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  26.07 
 
 		 577 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  37.23 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  40.59 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  43.37 
 
 		 481 aa  65.1  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  37.65 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  37.65 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  37.65 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  37.65 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.19 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  37.65 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  37.65 
 
 		 520 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  32.12 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  37.65 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  38.1 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  37.06 
 
 		 157 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.08 
 
 		 726 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02287  cytochrome C6  36.36 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.82 
 
 		 699 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  34.38 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.07 
 
 		 601 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  32.76 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3097  cytochrome c-552 like protein  38.33 
 
 		 106 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517981  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  30.23 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  36.9 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  40.48 
 
 		 587 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  34.26 
 
 		 728 aa  58.5  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 852 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  30.83 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0687  hypothetical protein  42.37 
 
 		 107 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594969  normal  0.0275518 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  33.73 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  34.94 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  30.7 
 
 		 773 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  30.77 
 
 		 675 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.76 
 
 		 440 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  32.38 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  27.44 
 
 		 669 aa  56.6  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  30.65 
 
 		 675 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  33.02 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 721 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 721 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  33.07 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  28.49 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.78 
 
 		 331 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  36.25 
 
 		 157 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  31.43 
 
 		 694 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  28.99 
 
 		 712 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  28.88 
 
 		 708 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.54 
 
 		 531 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.27 
 
 		 680 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.54 
 
 		 531 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  33.11 
 
 		 468 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1833  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  25.27 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  27.17 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  25.26 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.52 
 
 		 531 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  33.07 
 
 		 402 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>