287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02287 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02287  cytochrome C6  100 
 
 		 141 aa  288  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1534  putative cytochrome C6  54.37 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0283765  normal  0.795594 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  52.04 
 
 		 251 aa  107  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0703  cytochrome c class I  54.84 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  37.78 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  40.82 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  38.71 
 
 		 214 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  40.59 
 
 		 218 aa  87.4  7e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1132  cytochrome c, class I  40 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.300286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2358  cytochrome c, class I  34.17 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 680 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  35.45 
 
 		 385 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  32.65 
 
 		 476 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  40.86 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  35.04 
 
 		 285 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 470 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 		 418 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  32.48 
 
 		 418 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.29 
 
 		 440 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  34.71 
 
 		 538 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  31.29 
 
 		 469 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.86 
 
 		 417 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  31.62 
 
 		 390 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.86 
 
 		 417 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.55 
 
 		 415 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  37.29 
 
 		 373 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32 
 
 		 433 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.27 
 
 		 469 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  33.79 
 
 		 439 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 378 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.55 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.71 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  28.86 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  39.8 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.81 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.55 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  37.11 
 
 		 421 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.55 
 
 		 531 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  37.11 
 
 		 422 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.21 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  33 
 
 		 407 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 557 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 525 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  35.21 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 517 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.17 
 
 		 1191 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.14 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  38.78 
 
 		 385 aa  58.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  33.1 
 
 		 439 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  32.99 
 
 		 385 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 477 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  33.88 
 
 		 544 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.03 
 
 		 439 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  35.9 
 
 		 434 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.58 
 
 		 401 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  37.11 
 
 		 525 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  37.23 
 
 		 519 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  33.61 
 
 		 523 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.04 
 
 		 451 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.22 
 
 		 575 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 421 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.96 
 
 		 451 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.88 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  34.71 
 
 		 434 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  36.73 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  35.42 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  33.96 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.05 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 520 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  32.39 
 
 		 430 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  36.94 
 
 		 468 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.37 
 
 		 470 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  35.79 
 
 		 387 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  34.97 
 
 		 437 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  37.96 
 
 		 419 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  31.21 
 
 		 430 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  35.05 
 
 		 531 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  36.08 
 
 		 532 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  29.17 
 
 		 438 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  31.21 
 
 		 430 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  36.08 
 
 		 532 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  36.08 
 
 		 532 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  37.14 
 
 		 975 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  31.21 
 
 		 430 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.79 
 
 		 395 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  32.71 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.29 
 
 		 538 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  35.11 
 
 		 518 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  36.94 
 
 		 438 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  35.05 
 
 		 535 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>