More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2315 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1848  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.54 
 
 
780 aa  838    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  71.38 
 
 
1187 aa  1733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  59.55 
 
 
1182 aa  1341    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56 
 
 
1179 aa  1256    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2509  isoquinoline 1-oxidoreductase  59.21 
 
 
759 aa  817    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  43.42 
 
 
976 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  61.25 
 
 
1181 aa  1421    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3930  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.54 
 
 
766 aa  792    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0713425  normal  0.0997312 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4552  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.96 
 
 
794 aa  807    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.394306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3932  isoquinoline 1-oxidoreductase  57.73 
 
 
764 aa  826    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  100 
 
 
1191 aa  2444    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  59.03 
 
 
1183 aa  1347    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2491  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.15 
 
 
761 aa  793    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  58.97 
 
 
1215 aa  1316    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  58.4 
 
 
1202 aa  1367    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  71.14 
 
 
1187 aa  1726    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  70.99 
 
 
1187 aa  1730    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.33 
 
 
1253 aa  1259    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3673  putative aldehyde dehydrogenase  61.13 
 
 
748 aa  890    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582789  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  58.34 
 
 
1207 aa  1369    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3488  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.37 
 
 
760 aa  803    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454711 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  71.21 
 
 
1187 aa  1721    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4329  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.41 
 
 
795 aa  819    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4037  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  56.41 
 
 
795 aa  819    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43790  putative aldehyde dehydrogenase  60.59 
 
 
748 aa  879    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.813342  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.46 
 
 
996 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  38.75 
 
 
975 aa  534  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.28 
 
 
831 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.16 
 
 
795 aa  503  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8451  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.97 
 
 
740 aa  503  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60331  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  45.62 
 
 
806 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  45.62 
 
 
806 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3137  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  41.25 
 
 
736 aa  500  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.488373  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0237  Isoquinoline 1-oxidoreductase  41.31 
 
 
741 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.99394  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1181  twin-arginine translocation pathway signal  39.03 
 
 
746 aa  486  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3374  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.08 
 
 
731 aa  479  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.977623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3005  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  40.39 
 
 
760 aa  469  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2505  putative oxidoreductase, beta subunit  38.47 
 
 
756 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  54.5 
 
 
433 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  52.97 
 
 
433 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.07 
 
 
432 aa  429  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4956  putative aldehyde dehydrogenase  38.57 
 
 
757 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426554  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5703  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.94 
 
 
756 aa  422  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.051575 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5820  putative aldehyde dehydrogenase  38.01 
 
 
753 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.318558  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6356  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  38.15 
 
 
753 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.401473  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5603  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.29 
 
 
753 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1472  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  38.15 
 
 
753 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1907  twin-arginine translocation pathway signal  37.13 
 
 
749 aa  419  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5506  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.83 
 
 
754 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7022  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  38.01 
 
 
753 aa  416  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35241  normal  0.158422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.23 
 
 
443 aa  409  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  48.24 
 
 
428 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.24 
 
 
428 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  48.24 
 
 
428 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.65 
 
 
426 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  46.95 
 
 
426 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.13 
 
 
425 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2446  twin-arginine translocation pathway signal  37.7 
 
 
745 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  46.65 
 
 
424 aa  389  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0897  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  37.27 
 
 
713 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958278  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.25 
 
 
433 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.77 
 
 
442 aa  350  9e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  42.66 
 
 
467 aa  344  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  45.31 
 
 
424 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  43.86 
 
 
420 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  42.99 
 
 
432 aa  339  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.73 
 
 
429 aa  338  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.9 
 
 
432 aa  329  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4458  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  36.02 
 
 
670 aa  325  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  41.59 
 
 
432 aa  320  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3127  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.9 
 
 
728 aa  309  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2353  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  31.76 
 
 
684 aa  297  9e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0875  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  33.38 
 
 
698 aa  294  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.0669846 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3102  molybdopterin-binding xanthine dehydrogenase  31.44 
 
 
707 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1932  isoquinoline 1-oxidoreductase  30.87 
 
 
715 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0863  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  28.46 
 
 
710 aa  283  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  39.53 
 
 
425 aa  281  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  39.96 
 
 
698 aa  281  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.67 
 
 
425 aa  281  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  38.67 
 
 
425 aa  281  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  38.67 
 
 
425 aa  281  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  39.81 
 
 
492 aa  278  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  39.07 
 
 
425 aa  278  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.59 
 
 
448 aa  278  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  40.54 
 
 
452 aa  278  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.71 
 
 
425 aa  277  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  40.54 
 
 
452 aa  277  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  38.37 
 
 
425 aa  277  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  40.54 
 
 
452 aa  277  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  40.54 
 
 
452 aa  277  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  40.54 
 
 
452 aa  277  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  40.54 
 
 
452 aa  277  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.09 
 
 
424 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  39.81 
 
 
497 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.95 
 
 
430 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  41.84 
 
 
424 aa  274  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  41.23 
 
 
447 aa  274  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.27 
 
 
425 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.43 
 
 
680 aa  272  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  39.95 
 
 
430 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>