More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0473 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  100 
 
 
268 aa  537  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  53.73 
 
 
251 aa  276  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  49.46 
 
 
151 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  46.6 
 
 
202 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  35.16 
 
 
205 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  46.53 
 
 
516 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  46.53 
 
 
516 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  46.53 
 
 
520 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  46.53 
 
 
520 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  46.53 
 
 
520 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  46.53 
 
 
520 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  46.53 
 
 
520 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  46.53 
 
 
520 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  34.4 
 
 
149 aa  95.9  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  45.54 
 
 
479 aa  95.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  45.54 
 
 
510 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  46.94 
 
 
147 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  48.7 
 
 
217 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  47.47 
 
 
158 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  43.56 
 
 
499 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  43.56 
 
 
499 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  38.02 
 
 
159 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  42.61 
 
 
189 aa  85.9  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  48.24 
 
 
203 aa  85.9  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  36.54 
 
 
147 aa  85.5  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  40.38 
 
 
202 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  47.06 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  38.68 
 
 
675 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.46 
 
 
699 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  37.27 
 
 
675 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  44.44 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  42.48 
 
 
1055 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  43.01 
 
 
146 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  38.26 
 
 
669 aa  80.1  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  39.45 
 
 
577 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  43.81 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  38.39 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  42.59 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  42.59 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.26 
 
 
419 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.36 
 
 
689 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  42.98 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  42.99 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  45.45 
 
 
136 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  38.61 
 
 
142 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  42.99 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.47 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  35.26 
 
 
197 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  38.74 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  41.3 
 
 
150 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  37.36 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.05 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.78 
 
 
601 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  34.45 
 
 
773 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  37.17 
 
 
420 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  36.89 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  42.27 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  39.64 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  40.71 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  34.55 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.48 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.83 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.07 
 
 
1068 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 
511 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  38.38 
 
 
712 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.39 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.37 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  42.61 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  42.61 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  42.61 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  37.17 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  42.2 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  40.74 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.74 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  40.71 
 
 
481 aa  73.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  40.37 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  40.37 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  43.18 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.37 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  40.37 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  43.88 
 
 
440 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1534  putative cytochrome C6  38.1 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0283765  normal  0.795594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  41.67 
 
 
728 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  36.67 
 
 
691 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  41.18 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  41.67 
 
 
432 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  41.67 
 
 
432 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  41.67 
 
 
432 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  41.67 
 
 
432 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  41.67 
 
 
432 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.94 
 
 
440 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  41.67 
 
 
432 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  41.67 
 
 
432 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  35.42 
 
 
524 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  39.81 
 
 
439 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4418  cytochrome c, class I  37.17 
 
 
419 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3948  cytochrome c, class I  37.17 
 
 
419 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130568  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.81 
 
 
441 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  28.1 
 
 
145 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.45 
 
 
432 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>