More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1620 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  45.18 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  43.62 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  41.71 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  38.78 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  39.27 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  37.97 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  40.31 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  51.79 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50 
 
 		 601 aa  99.4  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  44.12 
 
 		 577 aa  98.6  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  47 
 
 		 1068 aa  94.4  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  47.87 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  37.91 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  46.67 
 
 		 587 aa  88.2  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 		 759 aa  87.8  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  43.52 
 
 		 268 aa  85.5  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  46 
 
 		 1055 aa  85.1  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  40.37 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  43.3 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.28 
 
 		 773 aa  81.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  39.82 
 
 		 391 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.45 
 
 		 575 aa  81.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  38.38 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  31.69 
 
 		 136 aa  80.5  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  39.42 
 
 		 516 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.59 
 
 		 726 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  48.35 
 
 		 439 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  40.66 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  42.16 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  48.35 
 
 		 439 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  38 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  41.24 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  41.24 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  38 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  41.24 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  38 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  37.98 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  43 
 
 		 147 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  38 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.24 
 
 		 447 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.59 
 
 		 852 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.96 
 
 		 762 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  40 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.81 
 
 		 439 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  40.37 
 
 		 775 aa  75.5  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  34.75 
 
 		 510 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.59 
 
 		 448 aa  75.1  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  42.71 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  36.7 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.75 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.75 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  34.62 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  34.62 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  42.27 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  41.58 
 
 		 470 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  41.12 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.62 
 
 		 426 aa  72.8  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.6 
 
 		 433 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.05 
 
 		 477 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 475 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.89 
 
 		 475 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  36.89 
 
 		 475 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 477 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.71 
 
 		 469 aa  72  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.6 
 
 		 440 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.75 
 
 		 415 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  38.2 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.2 
 
 		 470 aa  71.2  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.75 
 
 		 415 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  38.64 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  38.83 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2870  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  40.78 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870199  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  39.64 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.44 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  35.24 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  40 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  35.78 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.86 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  44.83 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.57 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  35.67 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  37.96 
 
 		 708 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  36.07 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  36.07 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  40.52 
 
 		 382 aa  68.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  42.11 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.84 
 
 		 451 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  38.32 
 
 		 509 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.57 
 
 		 427 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  32.33 
 
 		 407 aa  68.6  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 463 aa  68.2  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  37.39 
 
 		 675 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  37.21 
 
 		 481 aa  67.8  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  38.32 
 
 		 721 aa  67  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 698 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.24 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  43.18 
 
 		 405 aa  67  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  35.88 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>