More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1761 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 680 aa  1368    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  44.39 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.49 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.3 
 
 		 444 aa  311  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.79 
 
 		 531 aa  310  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.87 
 
 		 432 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.12 
 
 		 531 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  41.98 
 
 		 432 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  41.48 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  41.48 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  41.48 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  41.48 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  41.48 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  43.37 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  41.13 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  41.48 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  41.48 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.6 
 
 		 432 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  41.6 
 
 		 432 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.24 
 
 		 432 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 432 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 432 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  42.28 
 
 		 415 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  42.35 
 
 		 415 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.53 
 
 		 474 aa  297  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.09 
 
 		 403 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.31 
 
 		 575 aa  295  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.38 
 
 		 432 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.1 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.43 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.24 
 
 		 434 aa  291  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  40.05 
 
 		 429 aa  291  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  40.54 
 
 		 421 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.58 
 
 		 426 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  39.71 
 
 		 468 aa  290  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  44.12 
 
 		 434 aa  290  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  42.67 
 
 		 437 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3798  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.96 
 
 		 403 aa  289  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679754 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.55 
 
 		 424 aa  289  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.33 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  40.19 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1632  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.75 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.15 
 
 		 426 aa  287  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  39.68 
 
 		 416 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.31 
 
 		 430 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 469 aa  286  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.16 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.32 
 
 		 432 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.19 
 
 		 448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  40.7 
 
 		 419 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  40.05 
 
 		 432 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.66 
 
 		 538 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  40.66 
 
 		 463 aa  283  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.6 
 
 		 466 aa  282  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  44.39 
 
 		 447 aa  283  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  40.31 
 
 		 430 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  39.95 
 
 		 430 aa  280  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  40.29 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.75 
 
 		 440 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.52 
 
 		 439 aa  278  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  42.08 
 
 		 425 aa  278  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.16 
 
 		 447 aa  278  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.5 
 
 		 461 aa  278  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  40.48 
 
 		 430 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  42.32 
 
 		 425 aa  277  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  40.48 
 
 		 430 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  41.18 
 
 		 439 aa  277  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.68 
 
 		 530 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.99 
 
 		 699 aa  276  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.37 
 
 		 425 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  43.04 
 
 		 554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  41.61 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.84 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.61 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  41.61 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2479  cytochrome c family protein  39.02 
 
 		 407 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  42.21 
 
 		 477 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  41.37 
 
 		 425 aa  275  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  42.55 
 
 		 976 aa  274  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.24 
 
 		 395 aa  273  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  40.05 
 
 		 439 aa  273  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  38.5 
 
 		 698 aa  273  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  39.51 
 
 		 476 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.38 
 
 		 689 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.43 
 
 		 1191 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.25 
 
 		 537 aa  272  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 429 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.92 
 
 		 527 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  38.93 
 
 		 728 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  41.5 
 
 		 475 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.5 
 
 		 475 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  41.5 
 
 		 475 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.92 
 
 		 477 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  41.6 
 
 		 1182 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  40.05 
 
 		 694 aa  270  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  41.12 
 
 		 712 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  40.66 
 
 		 439 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  40.05 
 
 		 721 aa  270  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.18 
 
 		 411 aa  270  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>