More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2566 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  87.47 
 
 
417 aa  744    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  77.35 
 
 
433 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  74.51 
 
 
439 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
415 aa  855    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  87.23 
 
 
417 aa  744    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  87.23 
 
 
415 aa  749    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  74.76 
 
 
439 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  73.2 
 
 
439 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  69.52 
 
 
439 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65.71 
 
 
451 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  70.33 
 
 
469 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  67.77 
 
 
475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  67.77 
 
 
470 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  67.77 
 
 
475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  67.77 
 
 
475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  67.6 
 
 
477 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.24 
 
 
477 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  60.4 
 
 
448 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  58.23 
 
 
450 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.99 
 
 
470 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.96 
 
 
426 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.36 
 
 
447 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.67 
 
 
467 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.98 
 
 
448 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  52.3 
 
 
434 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  52.3 
 
 
434 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.54 
 
 
434 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  53.94 
 
 
432 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.69 
 
 
432 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  53.69 
 
 
432 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  53.35 
 
 
434 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  53.69 
 
 
432 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  52.93 
 
 
439 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.06 
 
 
434 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.16 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.23 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.3 
 
 
448 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.02 
 
 
422 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  51.25 
 
 
447 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  51.37 
 
 
447 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  51.64 
 
 
453 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  51.78 
 
 
450 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.12 
 
 
426 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  50.26 
 
 
430 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.26 
 
 
454 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  49.53 
 
 
698 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  50.37 
 
 
447 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  49.24 
 
 
466 aa  385  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  48.92 
 
 
675 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  48.72 
 
 
432 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  49.16 
 
 
675 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  48.11 
 
 
438 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  47.52 
 
 
463 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.2 
 
 
440 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.54 
 
 
451 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  46.98 
 
 
773 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  46.99 
 
 
473 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  47.79 
 
 
728 aa  364  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.84 
 
 
689 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.84 
 
 
395 aa  359  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.45 
 
 
426 aa  358  8e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  45.78 
 
 
669 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  49.75 
 
 
712 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  47.72 
 
 
694 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  46.89 
 
 
509 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  47.47 
 
 
721 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  46.81 
 
 
708 aa  352  8e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  47.71 
 
 
721 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  45.95 
 
 
476 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.39 
 
 
726 aa  348  9e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  48.46 
 
 
691 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  47.78 
 
 
452 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  47.54 
 
 
452 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.07 
 
 
699 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.95 
 
 
433 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  47.29 
 
 
497 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  47.04 
 
 
492 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  47.54 
 
 
452 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  47.54 
 
 
452 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  47.54 
 
 
452 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  47.54 
 
 
452 aa  342  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  44.44 
 
 
469 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5692  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.46 
 
 
428 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0139384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  44.47 
 
 
425 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.08 
 
 
425 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4612  cytochrome c, class I  46.23 
 
 
428 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3756  cytochrome c, class I  46.23 
 
 
428 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.42 
 
 
427 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  43.62 
 
 
425 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.58 
 
 
425 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  43.85 
 
 
425 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.78 
 
 
425 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  43.78 
 
 
425 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  43.78 
 
 
425 aa  332  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.01 
 
 
432 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  45.01 
 
 
432 aa  330  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.82 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.75 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.98 
 
 
432 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.63 
 
 
432 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>