211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2358 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2358  cytochrome c, class I  100 
 
 		 217 aa  457  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1132  cytochrome c, class I  57.87 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.300286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  48.87 
 
 		 218 aa  217  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  48.85 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  44.55 
 
 		 251 aa  94  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1534  putative cytochrome C6  40.17 
 
 		 143 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0283765  normal  0.795594 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  40.2 
 
 		 143 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0703  cytochrome c class I  41 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  40.79 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  32.68 
 
 		 425 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  32.68 
 
 		 425 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.68 
 
 		 425 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  32.68 
 
 		 425 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  32.68 
 
 		 425 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02287  cytochrome C6  37 
 
 		 141 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  35.09 
 
 		 492 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.72 
 
 		 425 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.07 
 
 		 425 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  30.07 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  34.21 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.78 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  34.21 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  34.21 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.86 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.26 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  29.34 
 
 		 432 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  38.68 
 
 		 468 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  35.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  35.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  35.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.74 
 
 		 461 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  35.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  35.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  35.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  35.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.5 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  34.91 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  32.08 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  29.71 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.85 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.96 
 
 		 432 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 432 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 432 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.96 
 
 		 432 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  34.21 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.96 
 
 		 432 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 432 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  33.33 
 
 		 430 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  35.8 
 
 		 1215 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 430 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  33.02 
 
 		 432 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 430 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.21 
 
 		 469 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.96 
 
 		 447 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  34.12 
 
 		 407 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  35.51 
 
 		 438 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.19 
 
 		 575 aa  53.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  34.29 
 
 		 274 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  34.44 
 
 		 158 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  32.08 
 
 		 421 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  32.08 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  29.57 
 
 		 161 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  28.29 
 
 		 433 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 501 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.11 
 
 		 474 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  29.7 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  41.67 
 
 		 385 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  30.69 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  26.32 
 
 		 417 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  32.67 
 
 		 335 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  31.03 
 
 		 1202 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.58 
 
 		 425 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 427 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  28.29 
 
 		 439 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  26.56 
 
 		 976 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.33 
 
 		 451 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  30.16 
 
 		 150 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.69 
 
 		 426 aa  49.3  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.11 
 
 		 432 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  36.47 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.03 
 
 		 1207 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.63 
 
 		 439 aa  48.9  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1396  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  34.07 
 
 		 304 aa  48.5  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  38.81 
 
 		 701 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  32.94 
 
 		 268 aa  48.5  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 447 aa  48.1  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.57 
 
 		 680 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  33.67 
 
 		 139 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  38.67 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  25.66 
 
 		 439 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 433 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>