260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1826 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02287  cytochrome C6  50.44 
 
 		 141 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  38.61 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1534  putative cytochrome C6  49.48 
 
 		 143 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0283765  normal  0.795594 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  47.52 
 
 		 218 aa  99.4  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  39.85 
 
 		 143 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  47.92 
 
 		 141 aa  95.9  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1132  cytochrome c, class I  45 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.300286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2358  cytochrome c, class I  45 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0703  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 139 aa  85.1  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  36.26 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  32.62 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  32.31 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  31.21 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  37.14 
 
 		 438 aa  58.5  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.04 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.61 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  41.98 
 
 		 97 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.61 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.3 
 
 		 415 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  33.33 
 
 		 390 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  38.78 
 
 		 425 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  38.78 
 
 		 425 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.78 
 
 		 425 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 420 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  38.78 
 
 		 425 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  30.71 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 419 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  30.46 
 
 		 382 aa  55.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  39.8 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  27.04 
 
 		 401 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  29.08 
 
 		 439 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.8 
 
 		 425 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  31.53 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  35.64 
 
 		 429 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.08 
 
 		 439 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  39.8 
 
 		 425 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  38.27 
 
 		 97 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 452 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 452 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 497 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  37.14 
 
 		 452 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 452 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  37.14 
 
 		 452 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  37.14 
 
 		 452 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.57 
 
 		 680 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1781  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 451 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 285 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1151  cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  37.5 
 
 		 451 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 492 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.66 
 
 		 1068 aa  52  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  34.04 
 
 		 418 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  29.82 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  34.04 
 
 		 418 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  32.71 
 
 		 548 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  32.08 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  32.08 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.19 
 
 		 1055 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  32.08 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  28.1 
 
 		 433 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  32.08 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.56 
 
 		 419 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  31.75 
 
 		 476 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  35.62 
 
 		 538 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  33.66 
 
 		 427 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  32.08 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1130  putative cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  36.73 
 
 		 484 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  32.08 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  37.33 
 
 		 154 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32 
 
 		 466 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  30.43 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  32.08 
 
 		 432 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.48 
 
 		 418 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  30.7 
 
 		 166 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  28.97 
 
 		 437 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  37.89 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  32.71 
 
 		 432 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  29.08 
 
 		 434 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.69 
 
 		 432 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  32.69 
 
 		 432 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  30.19 
 
 		 391 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  30.7 
 
 		 166 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  32.48 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  35 
 
 		 331 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.41 
 
 		 467 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  29.32 
 
 		 447 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.37 
 
 		 434 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.97 
 
 		 432 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 150 aa  49.3  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.82 
 
 		 447 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  33.93 
 
 		 466 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  26.01 
 
 		 433 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.73 
 
 		 425 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 385 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 		 557 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>