243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1425 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  100 
 
 
97 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  93.81 
 
 
97 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2522  cytochrome c class I  95.89 
 
 
97 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2405  cytochrome c class I  60 
 
 
100 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.475879  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0759  cytochrome c, class I  53.92 
 
 
100 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.940622  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  44.21 
 
 
101 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3841  cytochrome c variant  41.89 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  40 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  34.07 
 
 
284 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  38.89 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  37.5 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  39.56 
 
 
251 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3495  cytochrome c class I  35.56 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.78 
 
 
293 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  38.24 
 
 
111 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1787  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.66 
 
 
296 aa  53.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.832372  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0703  cytochrome c class I  41.89 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  35.29 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  36.36 
 
 
290 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0693  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoP subunit  34.52 
 
 
290 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2348  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.52 
 
 
290 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.765339  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  31.46 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4618  cytochrome c, class I  35.44 
 
 
111 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.02 
 
 
349 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1280  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.02 
 
 
296 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1566  diheme cytochrome c  45.59 
 
 
324 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3829  cytochrome c, class I  38.14 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.82757  normal  0.284345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  33.66 
 
 
111 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  30.38 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  35.11 
 
 
503 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  38.89 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0537  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.1 
 
 
292 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.931468  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0809  cytochrome c, class I  36.84 
 
 
141 aa  50.1  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02300  hypothetical protein  44.12 
 
 
324 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003470  cytochrome c oxidase subunit CcoP  44.12 
 
 
324 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.204703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  32.65 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  33.77 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2044  cytochrome c, class I  38.2 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.81366e-16 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  34.57 
 
 
385 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0879  cytochrome c class I  30 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1422  hypothetical protein  35.06 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000667886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  34.41 
 
 
329 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1529  cytochrome c6  30.61 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.389738  normal  0.935702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.16 
 
 
293 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  41.18 
 
 
310 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  36.59 
 
 
385 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  35.9 
 
 
214 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2114  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.41 
 
 
293 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1050  cytochrome c oxidase, subunit CcoP  40.24 
 
 
326 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.26248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5233  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.41 
 
 
293 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3132  hydroxylamine reductase  30.34 
 
 
504 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1710  cytochrome d1 heme region  33.33 
 
 
566 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.111193  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.37 
 
 
298 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  34.52 
 
 
538 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  37.8 
 
 
304 aa  47.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  34.34 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  35.96 
 
 
390 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  35.92 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  35.92 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.24 
 
 
312 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1905  cytochrome d1, heme region  33.33 
 
 
542 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275872  normal  0.619697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  38.96 
 
 
528 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  36.71 
 
 
544 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.86 
 
 
308 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_004310  BR0360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.18 
 
 
287 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1087  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  44.29 
 
 
304 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.497321  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0376  cytochrome c oxidase, Cbb3-type, subunit III  37.18 
 
 
287 aa  47  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  35.21 
 
 
163 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.06 
 
 
293 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  31 
 
 
103 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3207  cytochrome c class I  33.75 
 
 
115 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.565348  decreased coverage  0.00513342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
557 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2440  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.84 
 
 
288 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132686  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0466  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.46 
 
 
287 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00151581  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  31.87 
 
 
291 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  33.72 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  31 
 
 
104 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  31 
 
 
104 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.84 
 
 
293 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  44.29 
 
 
304 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  31.65 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  31.65 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  31 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2778  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.86 
 
 
305 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.452004  normal  0.247491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  34.72 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.14 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  33.33 
 
 
374 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1814  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2542  putative cytochrome C6-2  33.33 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0112262  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0634  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.24 
 
 
304 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  35.53 
 
 
698 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  40 
 
 
307 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.58 
 
 
430 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2358  cytochrome c, class I  28.24 
 
 
217 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.58 
 
 
430 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.49 
 
 
298 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.24 
 
 
311 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17581  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  35.24 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4116  cytochrome c class I  29.21 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.58 
 
 
426 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>