More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1926 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  100 
 
 		 150 aa  309  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  59.6 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  50.78 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  50.79 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  42.57 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  45.64 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  50 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  45.53 
 
 		 232 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  37.93 
 
 		 153 aa  95.9  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  42.37 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  40.18 
 
 		 166 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  40.18 
 
 		 166 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  36.52 
 
 		 165 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  40.18 
 
 		 166 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  39.13 
 
 		 166 aa  87  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  40 
 
 		 166 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  45.16 
 
 		 499 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  39.84 
 
 		 202 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  45.16 
 
 		 499 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  44.09 
 
 		 510 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  45 
 
 		 217 aa  84.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  39.84 
 
 		 203 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  40 
 
 		 189 aa  83.6  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  41.18 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  43.48 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  40.71 
 
 		 516 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  40.71 
 
 		 520 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  40.71 
 
 		 520 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  38.66 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  41.94 
 
 		 520 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  41.94 
 
 		 520 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  41.94 
 
 		 520 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  41.94 
 
 		 520 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  40.71 
 
 		 516 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  39.42 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  44.09 
 
 		 479 aa  79.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  37.1 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  38.26 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 708 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.02 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  44.32 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.26 
 
 		 429 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  38.46 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  42.55 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  36.28 
 
 		 577 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.52 
 
 		 439 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  36.56 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  35.4 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  38.78 
 
 		 424 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.78 
 
 		 424 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  36.07 
 
 		 437 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  34.35 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.19 
 
 		 601 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.81 
 
 		 726 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  39.58 
 
 		 391 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.01 
 
 		 447 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.83 
 
 		 432 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  36.61 
 
 		 481 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.71 
 
 		 699 aa  67.8  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  33.08 
 
 		 432 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  33.08 
 
 		 432 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  33.08 
 
 		 432 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  33.08 
 
 		 432 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  33.08 
 
 		 432 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 587 aa  67.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  33.08 
 
 		 432 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  33.08 
 
 		 432 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.16 
 
 		 1068 aa  67  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  44.09 
 
 		 405 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  33.08 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  33.08 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  35.21 
 
 		 511 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.75 
 
 		 448 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  33.08 
 
 		 432 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  38.39 
 
 		 469 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.08 
 
 		 432 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  33.08 
 
 		 432 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  29.75 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  36.19 
 
 		 427 aa  65.1  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.65 
 
 		 417 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  35.65 
 
 		 417 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  33.07 
 
 		 463 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  38.54 
 
 		 338 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  38.2 
 
 		 675 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 728 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.6 
 
 		 852 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  36.11 
 
 		 773 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.05 
 
 		 440 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.17 
 
 		 448 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  38.2 
 
 		 675 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>