More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2669 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  82.87 
 
 
432 aa  730    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  95.6 
 
 
432 aa  827    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  95.6 
 
 
432 aa  827    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  95.6 
 
 
432 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  95.6 
 
 
432 aa  827    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  97.45 
 
 
432 aa  830    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  97.92 
 
 
432 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  83.33 
 
 
432 aa  737    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  94.91 
 
 
432 aa  822    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  83.56 
 
 
432 aa  735    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  95.6 
 
 
432 aa  827    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  95.6 
 
 
432 aa  827    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  95.6 
 
 
432 aa  827    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  100 
 
 
432 aa  899    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  100 
 
 
432 aa  899    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 
432 aa  899    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  97.92 
 
 
432 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  97.69 
 
 
432 aa  830    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  67.09 
 
 
430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  68.22 
 
 
430 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  67.44 
 
 
430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  67.44 
 
 
430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  60.97 
 
 
421 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  67.01 
 
 
419 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  64.48 
 
 
447 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  60.14 
 
 
461 aa  548  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  62.31 
 
 
468 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  61.86 
 
 
461 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  52.56 
 
 
428 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  48.37 
 
 
429 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  48.07 
 
 
427 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.68 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  50.14 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.77 
 
 
429 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  48.42 
 
 
424 aa  396  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.07 
 
 
425 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  48.86 
 
 
437 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  47.15 
 
 
429 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  47.74 
 
 
438 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  45.39 
 
 
407 aa  349  6e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.63 
 
 
447 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  45.72 
 
 
433 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.03 
 
 
448 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  44.57 
 
 
391 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.73 
 
 
415 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  42.93 
 
 
439 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.99 
 
 
444 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  42.52 
 
 
439 aa  319  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.15 
 
 
417 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  42.49 
 
 
439 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  43.26 
 
 
430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.07 
 
 
415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.07 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.69 
 
 
474 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.64 
 
 
531 aa  312  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.4 
 
 
422 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.61 
 
 
426 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.12 
 
 
531 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.75 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  40.05 
 
 
463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.95 
 
 
680 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.6 
 
 
426 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  40.25 
 
 
447 aa  302  9e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.86 
 
 
531 aa  302  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  40.51 
 
 
450 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  38.08 
 
 
438 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  39 
 
 
476 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.4 
 
 
403 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  38.82 
 
 
469 aa  299  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  40 
 
 
473 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  40.91 
 
 
477 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.61 
 
 
477 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.4 
 
 
454 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.62 
 
 
448 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.37 
 
 
530 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.21 
 
 
439 aa  292  9e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.37 
 
 
470 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  39.32 
 
 
415 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  41.73 
 
 
554 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  39.53 
 
 
415 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  40.45 
 
 
470 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  39.66 
 
 
434 aa  289  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.9 
 
 
434 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.18 
 
 
436 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.3 
 
 
537 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  40.35 
 
 
475 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.35 
 
 
475 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  39.75 
 
 
712 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  40.35 
 
 
475 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.34 
 
 
469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.65 
 
 
538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  39.14 
 
 
432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  39.39 
 
 
439 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.97 
 
 
448 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  39.39 
 
 
434 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  39.39 
 
 
434 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.71 
 
 
433 aa  286  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.99 
 
 
575 aa  285  8e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.54 
 
 
434 aa  285  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.34 
 
 
432 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>