More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1265 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  100 
 
 		 205 aa  416  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  67.37 
 
 		 202 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  48.91 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  45.55 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  41.62 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  40.84 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  40.31 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  42.28 
 
 		 151 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  50.5 
 
 		 251 aa  101  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  38.18 
 
 		 161 aa  101  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  39.66 
 
 		 510 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  37.11 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  51.61 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  40.95 
 
 		 499 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  40.95 
 
 		 499 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  37.36 
 
 		 268 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  41.58 
 
 		 142 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  38.1 
 
 		 520 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  38.1 
 
 		 520 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  38.1 
 
 		 520 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  38.1 
 
 		 516 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  38.1 
 
 		 520 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.1 
 
 		 516 aa  94  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  38.1 
 
 		 520 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  38.1 
 
 		 520 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 147 aa  91.7  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  42.02 
 
 		 146 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  39.25 
 
 		 577 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  37.62 
 
 		 479 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  38.71 
 
 		 149 aa  88.6  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 		 1068 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  39.6 
 
 		 147 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.19 
 
 		 601 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  37.61 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  43.3 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  38.66 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.36 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.16 
 
 		 1055 aa  79.7  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.2 
 
 		 762 aa  79  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  44.12 
 
 		 421 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.18 
 
 		 852 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  37.63 
 
 		 587 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.72 
 
 		 773 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  28.35 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  38.61 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.3 
 
 		 759 aa  77  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  38.21 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  38 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  41.07 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  38.94 
 
 		 338 aa  75.5  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  41.84 
 
 		 669 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  33.02 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  42.16 
 
 		 422 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.55 
 
 		 689 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  40.2 
 
 		 380 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.3 
 
 		 575 aa  71.6  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.72 
 
 		 447 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  41.12 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  32.04 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  33.06 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.39 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  37.86 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  38.39 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  38.83 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  41.35 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  38.83 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  35 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  38.83 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  40.78 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  37.82 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  38.53 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  36.19 
 
 		 439 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  38.83 
 
 		 535 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  38.83 
 
 		 535 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  40.96 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  38.83 
 
 		 392 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  38.83 
 
 		 531 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  36.61 
 
 		 470 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  40.23 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  34.23 
 
 		 548 aa  68.2  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  36.61 
 
 		 775 aa  68.2  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.71 
 
 		 475 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 475 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  35.71 
 
 		 475 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  31.19 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.83 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  40.38 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  36.51 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.1 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  37.86 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2870  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  34.71 
 
 		 334 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870199  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  36.03 
 
 		 492 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.82 
 
 		 451 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.05 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.28 
 
 		 469 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.38 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>