More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4058 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.23 
 
 
1179 aa  1228    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43790  putative aldehyde dehydrogenase  57.41 
 
 
748 aa  816    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.813342  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  58.9 
 
 
1187 aa  1396    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4552  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  57.24 
 
 
794 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.394306 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4037  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  57.31 
 
 
795 aa  794    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2509  isoquinoline 1-oxidoreductase  61.79 
 
 
759 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  42.02 
 
 
976 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  58.98 
 
 
1187 aa  1405    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3932  isoquinoline 1-oxidoreductase  60.21 
 
 
764 aa  837    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  61.5 
 
 
1182 aa  1328    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3488  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  57.26 
 
 
760 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  58.31 
 
 
1187 aa  1389    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  60.94 
 
 
1183 aa  1319    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  100 
 
 
1215 aa  2458    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  60.76 
 
 
1202 aa  1421    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  58.97 
 
 
1191 aa  1363    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2491  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  53.13 
 
 
761 aa  767    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3930  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  54.12 
 
 
766 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0713425  normal  0.0997312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  59.66 
 
 
1181 aa  1369    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1848  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  58.85 
 
 
780 aa  843    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  69.65 
 
 
1253 aa  1604    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  60.48 
 
 
1207 aa  1424    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4329  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  57.31 
 
 
795 aa  794    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3673  putative aldehyde dehydrogenase  58.08 
 
 
748 aa  820    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  58.73 
 
 
1187 aa  1388    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.43 
 
 
795 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  45.56 
 
 
806 aa  512  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  45.56 
 
 
806 aa  512  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.61 
 
 
831 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.31 
 
 
996 aa  502  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  44.08 
 
 
975 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3137  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  43.12 
 
 
736 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.488373  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8451  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  42.56 
 
 
740 aa  485  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0237  Isoquinoline 1-oxidoreductase  41.97 
 
 
741 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.99394  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1181  twin-arginine translocation pathway signal  39.86 
 
 
746 aa  479  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  54.55 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  54.44 
 
 
433 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3374  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.24 
 
 
731 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.977623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3005  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  38.72 
 
 
760 aa  446  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2505  putative oxidoreductase, beta subunit  37.81 
 
 
756 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.08 
 
 
432 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1907  twin-arginine translocation pathway signal  38.86 
 
 
749 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.63 
 
 
443 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5703  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.04 
 
 
756 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.051575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4956  putative aldehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
757 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426554  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5506  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.75 
 
 
754 aa  383  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6356  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  36.3 
 
 
753 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.401473  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1472  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  36.3 
 
 
753 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7022  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.16 
 
 
753 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35241  normal  0.158422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0897  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  37.94 
 
 
713 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958278  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.65 
 
 
425 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5820  putative aldehyde dehydrogenase  35.21 
 
 
753 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.318558  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5603  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.34 
 
 
753 aa  364  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  44.7 
 
 
467 aa  356  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2446  twin-arginine translocation pathway signal  36.31 
 
 
745 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.03 
 
 
426 aa  355  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  44.03 
 
 
426 aa  353  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  44.74 
 
 
432 aa  353  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  43.16 
 
 
432 aa  350  8e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  44.03 
 
 
420 aa  345  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.13 
 
 
429 aa  344  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.34 
 
 
433 aa  344  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.39 
 
 
428 aa  343  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  43.16 
 
 
428 aa  341  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  43.16 
 
 
428 aa  341  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  43.1 
 
 
424 aa  340  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.13 
 
 
432 aa  340  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  44.39 
 
 
424 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.8 
 
 
442 aa  332  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3127  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.44 
 
 
728 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4458  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.58 
 
 
670 aa  292  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0863  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.94 
 
 
710 aa  288  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1932  isoquinoline 1-oxidoreductase  32.61 
 
 
715 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  42.46 
 
 
425 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.2 
 
 
425 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.42 
 
 
425 aa  278  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  40.94 
 
 
425 aa  278  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.94 
 
 
425 aa  278  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  40.94 
 
 
425 aa  278  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  42.12 
 
 
492 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  42.51 
 
 
497 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  41.89 
 
 
452 aa  275  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  41.89 
 
 
452 aa  275  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  40.45 
 
 
425 aa  274  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  40.69 
 
 
425 aa  274  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  41.65 
 
 
452 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  41.65 
 
 
452 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  41.65 
 
 
452 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  41.65 
 
 
452 aa  273  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0875  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  34.13 
 
 
698 aa  268  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.0669846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.83 
 
 
448 aa  265  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2353  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  31.77 
 
 
684 aa  264  8e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.84 
 
 
395 aa  263  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3102  molybdopterin-binding xanthine dehydrogenase  31.86 
 
 
707 aa  262  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130356  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.15 
 
 
432 aa  261  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.83 
 
 
441 aa  261  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.74 
 
 
447 aa  260  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  41.83 
 
 
439 aa  260  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  38.54 
 
 
669 aa  260  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  40.93 
 
 
501 aa  259  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>