More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3607 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 429 aa  865    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.05 
 
 		 432 aa  588  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.76 
 
 		 442 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  54.17 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  51.95 
 
 		 432 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  45.93 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  47.03 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  47.02 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  48.89 
 
 		 1183 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  49.38 
 
 		 1182 aa  362  8e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  48.28 
 
 		 1181 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  45.03 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  45.03 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  46.8 
 
 		 1202 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.03 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  47.13 
 
 		 1215 aa  349  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  44.73 
 
 		 1191 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.82 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  46.19 
 
 		 1187 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  44.72 
 
 		 1187 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  45.85 
 
 		 1187 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.32 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  44.5 
 
 		 976 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  43.09 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.17 
 
 		 1207 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  45.12 
 
 		 1187 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.29 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  46.93 
 
 		 1253 aa  336  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  43.95 
 
 		 420 aa  335  7e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  46.06 
 
 		 806 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  46.06 
 
 		 806 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  44.5 
 
 		 975 aa  318  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.06 
 
 		 795 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.36 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.17 
 
 		 831 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.93 
 
 		 996 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.37 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  42.76 
 
 		 1179 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  40.14 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  46.12 
 
 		 497 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  46.37 
 
 		 452 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  46.12 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  46.12 
 
 		 492 aa  293  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  46.12 
 
 		 452 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  46.12 
 
 		 452 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  46.12 
 
 		 452 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  46.12 
 
 		 452 aa  292  6e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.74 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  44.74 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  43.07 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  40.76 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  43.32 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.86 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.98 
 
 		 469 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.59 
 
 		 432 aa  272  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  40.32 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  39 
 
 		 429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  42.39 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.39 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  42.39 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.4 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.62 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.69 
 
 		 474 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.36 
 
 		 425 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.97 
 
 		 447 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  39.08 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.08 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  38.22 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.52 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.6 
 
 		 448 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  38.36 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  40.16 
 
 		 419 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.12 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  39.25 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  39.25 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  39.25 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 432 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  39.25 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  39.25 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  39.25 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  39.25 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  42.68 
 
 		 429 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 440 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  38.54 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.54 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  38.54 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  41.69 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.69 
 
 		 424 aa  262  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.15 
 
 		 680 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  39.25 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.4 
 
 		 429 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  37.56 
 
 		 428 aa  259  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.8 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  39.4 
 
 		 430 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  39.4 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  39.4 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.5 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  40.09 
 
 		 447 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.01 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>