More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6039 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  53.31 
 
 
1253 aa  1161    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  58.3 
 
 
1187 aa  1317    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2509  isoquinoline 1-oxidoreductase  58.83 
 
 
759 aa  805    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4552  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.82 
 
 
794 aa  748    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.394306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3930  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  54.65 
 
 
766 aa  747    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0713425  normal  0.0997312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  59.91 
 
 
1181 aa  1372    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.91 
 
 
1191 aa  1276    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1848  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  57.75 
 
 
780 aa  832    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  56.32 
 
 
1207 aa  1266    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  100 
 
 
1179 aa  2415    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3488  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  56.84 
 
 
760 aa  753    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454711 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4037  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  57.37 
 
 
795 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  58.89 
 
 
1183 aa  1300    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  56.23 
 
 
1215 aa  1218    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  59.1 
 
 
1182 aa  1288    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  56.58 
 
 
1202 aa  1280    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  58.22 
 
 
1187 aa  1315    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  58.04 
 
 
1187 aa  1307    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  57.01 
 
 
1187 aa  1313    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2491  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.12 
 
 
761 aa  790    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3673  putative aldehyde dehydrogenase  58.3 
 
 
748 aa  817    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582789  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4329  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  57.37 
 
 
795 aa  759    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3932  isoquinoline 1-oxidoreductase  57.76 
 
 
764 aa  799    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43790  putative aldehyde dehydrogenase  57.59 
 
 
748 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.813342  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  38.14 
 
 
976 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8451  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  41.74 
 
 
740 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.31 
 
 
996 aa  489  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  38.31 
 
 
975 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0237  Isoquinoline 1-oxidoreductase  41.1 
 
 
741 aa  485  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.99394  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3137  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.76 
 
 
736 aa  485  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.488373  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3005  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  40.36 
 
 
760 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1181  twin-arginine translocation pathway signal  37.06 
 
 
746 aa  459  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3374  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  41.36 
 
 
731 aa  459  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.977623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2505  putative oxidoreductase, beta subunit  39.5 
 
 
756 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.41 
 
 
831 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.25 
 
 
795 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1907  twin-arginine translocation pathway signal  37.95 
 
 
749 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  40.03 
 
 
806 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  40.03 
 
 
806 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  48.95 
 
 
433 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5506  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.89 
 
 
754 aa  381  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0897  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  37.4 
 
 
713 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958278  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5703  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.6 
 
 
756 aa  379  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.051575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4956  putative aldehyde dehydrogenase  35.27 
 
 
757 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426554  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  47.32 
 
 
433 aa  370  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2446  twin-arginine translocation pathway signal  37.32 
 
 
745 aa  366  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5820  putative aldehyde dehydrogenase  34.14 
 
 
753 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.318558  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6356  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  34.7 
 
 
753 aa  356  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.401473  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1472  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  34.7 
 
 
753 aa  356  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5603  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.28 
 
 
753 aa  356  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7022  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.56 
 
 
753 aa  355  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35241  normal  0.158422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.98 
 
 
432 aa  351  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.96 
 
 
443 aa  332  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.99 
 
 
425 aa  332  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.24 
 
 
432 aa  326  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0863  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.87 
 
 
710 aa  318  5e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3127  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.82 
 
 
728 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  42.61 
 
 
432 aa  313  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.39 
 
 
442 aa  310  9e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.76 
 
 
429 aa  309  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.05 
 
 
428 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  39.68 
 
 
428 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  39.68 
 
 
428 aa  304  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.77 
 
 
426 aa  302  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  43.32 
 
 
420 aa  301  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  39.54 
 
 
426 aa  300  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0875  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  33.47 
 
 
698 aa  300  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.0669846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  38.62 
 
 
467 aa  299  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.23 
 
 
433 aa  298  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  40.45 
 
 
424 aa  298  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  41.61 
 
 
432 aa  296  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  39.68 
 
 
424 aa  295  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1932  isoquinoline 1-oxidoreductase  31.22 
 
 
715 aa  287  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4458  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  33.47 
 
 
670 aa  287  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3102  molybdopterin-binding xanthine dehydrogenase  31.72 
 
 
707 aa  282  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130356  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2353  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  31.35 
 
 
684 aa  278  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3212  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.95 
 
 
707 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3297  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32 
 
 
707 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0523127  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  40.9 
 
 
501 aa  261  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  39.41 
 
 
425 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.51 
 
 
425 aa  259  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.22 
 
 
425 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  38.67 
 
 
425 aa  254  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 
426 aa  253  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  38.18 
 
 
425 aa  253  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.18 
 
 
425 aa  253  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  39.61 
 
 
425 aa  253  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  38.18 
 
 
425 aa  253  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  39.45 
 
 
430 aa  252  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.97 
 
 
448 aa  251  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  38.88 
 
 
492 aa  250  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  39.89 
 
 
415 aa  248  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  38.39 
 
 
452 aa  247  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.21 
 
 
426 aa  247  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  38.39 
 
 
452 aa  247  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  38.24 
 
 
497 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.21 
 
 
469 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  39.68 
 
 
415 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.11 
 
 
422 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.28 
 
 
444 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>