More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4201 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 444 aa  915    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  50 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  43.74 
 
 		 421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  44.33 
 
 		 419 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 430 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  44.16 
 
 		 430 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  44.16 
 
 		 430 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.64 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.19 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.17 
 
 		 426 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.01 
 
 		 432 aa  332  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  44.16 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.72 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  43.75 
 
 		 432 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  43.6 
 
 		 468 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.86 
 
 		 461 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.19 
 
 		 448 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  39.58 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  47.04 
 
 		 391 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.19 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  40.24 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.99 
 
 		 432 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.99 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  40.99 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.58 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  40.99 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.6 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  40.99 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  40.99 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  40.99 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  40.99 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  40.47 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  40.99 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  40.99 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  40.99 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.13 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  40.47 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.47 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  40.47 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 531 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  41.44 
 
 		 698 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 531 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  41.93 
 
 		 473 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.46 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  41.84 
 
 		 407 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.74 
 
 		 531 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  40.34 
 
 		 728 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  40.23 
 
 		 429 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  40.92 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.3 
 
 		 680 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.05 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  41.07 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  41.07 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.07 
 
 		 432 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 501 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  41.07 
 
 		 432 aa  310  5e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.56 
 
 		 441 aa  309  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  41.58 
 
 		 440 aa  308  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  40.82 
 
 		 439 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.82 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  40.31 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  40.31 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  40 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  40.56 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  41.1 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  43.93 
 
 		 447 aa  306  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.35 
 
 		 469 aa  305  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  41.18 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.09 
 
 		 474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  41.49 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  40.3 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.12 
 
 		 433 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  39.26 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  40.18 
 
 		 509 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  40.74 
 
 		 476 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  40.56 
 
 		 433 aa  299  8e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.52 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.12 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.41 
 
 		 538 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  39.95 
 
 		 712 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  39.95 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  39.9 
 
 		 447 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.31 
 
 		 575 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.01 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3802  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.55 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.503165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.61 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  40.68 
 
 		 427 aa  294  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.8 
 
 		 699 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.65 
 
 		 432 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  42.75 
 
 		 721 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  44.47 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  38.55 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.59 
 
 		 454 aa  293  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  42.2 
 
 		 1187 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.05 
 
 		 453 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  39.55 
 
 		 669 aa  293  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  38.1 
 
 		 439 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.91 
 
 		 415 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  42.31 
 
 		 721 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>