More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2423 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  61.25 
 
 
1191 aa  1404    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3488  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  61.51 
 
 
760 aa  814    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2491  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.24 
 
 
761 aa  777    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  62.28 
 
 
1187 aa  1412    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2509  isoquinoline 1-oxidoreductase  63.05 
 
 
759 aa  872    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  44.02 
 
 
976 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4552  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  63.64 
 
 
794 aa  827    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.394306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  64.81 
 
 
1182 aa  1408    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  60.26 
 
 
1179 aa  1327    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43790  putative aldehyde dehydrogenase  60.48 
 
 
748 aa  835    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.813342  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  62.09 
 
 
1187 aa  1419    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  62.32 
 
 
1187 aa  1408    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  62.08 
 
 
1187 aa  1422    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1848  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  60.75 
 
 
780 aa  843    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  100 
 
 
1181 aa  2390    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3930  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  55.81 
 
 
766 aa  773    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0713425  normal  0.0997312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3673  putative aldehyde dehydrogenase  61.24 
 
 
748 aa  842    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582789  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  65.61 
 
 
1183 aa  1417    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  57.24 
 
 
1253 aa  1235    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  59.85 
 
 
1215 aa  1313    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  61.39 
 
 
1207 aa  1377    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  61.88 
 
 
1202 aa  1390    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3932  isoquinoline 1-oxidoreductase  57.56 
 
 
764 aa  815    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00339818 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4329  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  62.21 
 
 
795 aa  810    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4037  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  62.21 
 
 
795 aa  810    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.67 
 
 
996 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  40.89 
 
 
975 aa  535  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.66 
 
 
831 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8451  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  42.88 
 
 
740 aa  505  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60331  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.56 
 
 
795 aa  506  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  44.99 
 
 
806 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  44.99 
 
 
806 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3137  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  42.6 
 
 
736 aa  502  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.488373  normal  0.0182364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3374  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  41.97 
 
 
731 aa  487  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.977623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3005  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  43.6 
 
 
760 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0237  Isoquinoline 1-oxidoreductase  42.35 
 
 
741 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.99394  normal  0.25509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1181  twin-arginine translocation pathway signal  39.19 
 
 
746 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2505  putative oxidoreductase, beta subunit  40.42 
 
 
756 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  56.81 
 
 
433 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  54.82 
 
 
433 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1907  twin-arginine translocation pathway signal  38.3 
 
 
749 aa  439  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.203332  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.53 
 
 
432 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5506  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.83 
 
 
754 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5703  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.47 
 
 
756 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.051575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4956  putative aldehyde dehydrogenase  36.11 
 
 
757 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426554  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0897  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  37.67 
 
 
713 aa  396  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0958278  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5820  putative aldehyde dehydrogenase  34.94 
 
 
753 aa  390  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.318558  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6356  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.37 
 
 
753 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.401473  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1472  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.37 
 
 
753 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5603  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.8 
 
 
753 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7022  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.23 
 
 
753 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35241  normal  0.158422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.65 
 
 
443 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  45.31 
 
 
424 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.77 
 
 
428 aa  373  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2446  twin-arginine translocation pathway signal  36.2 
 
 
745 aa  373  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  45.77 
 
 
428 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.6 
 
 
425 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  45.77 
 
 
428 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.66 
 
 
432 aa  372  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  45.18 
 
 
467 aa  366  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  44.26 
 
 
426 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.26 
 
 
426 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.03 
 
 
433 aa  355  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  46.39 
 
 
420 aa  355  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.09 
 
 
429 aa  348  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.6 
 
 
442 aa  338  3.9999999999999995e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  43.02 
 
 
432 aa  335  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  45.2 
 
 
424 aa  330  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  41.86 
 
 
432 aa  327  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3127  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  31.53 
 
 
728 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4458  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.93 
 
 
670 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3102  molybdopterin-binding xanthine dehydrogenase  33.47 
 
 
707 aa  307  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130356  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2353  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  33.05 
 
 
684 aa  300  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0863  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  30.59 
 
 
710 aa  299  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3212  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.78 
 
 
707 aa  294  8e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.395113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0875  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.19 
 
 
698 aa  293  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.62493  normal  0.0669846 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3297  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  32.78 
 
 
707 aa  293  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0523127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1932  isoquinoline 1-oxidoreductase  31.05 
 
 
715 aa  288  5e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.18 
 
 
448 aa  281  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.25 
 
 
425 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  41.25 
 
 
425 aa  278  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.35 
 
 
425 aa  278  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 
425 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  40 
 
 
425 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  40 
 
 
425 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.34 
 
 
531 aa  274  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  39.8 
 
 
425 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.27 
 
 
531 aa  272  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  40.05 
 
 
425 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  40.95 
 
 
501 aa  271  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.27 
 
 
531 aa  269  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  39.43 
 
 
429 aa  269  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  39.38 
 
 
426 aa  268  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  40.3 
 
 
691 aa  266  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  41.22 
 
 
712 aa  266  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.24 
 
 
680 aa  265  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  39.12 
 
 
430 aa  265  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.51 
 
 
432 aa  265  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  40.31 
 
 
698 aa  264  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  39.35 
 
 
492 aa  262  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>