More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1001 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1001  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  100 
 
 		 430 aa  900    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  97.91 
 
 		 430 aa  851    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  98.6 
 
 		 430 aa  892    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1104  cytochrome c, class I  84.1 
 
 		 416 aa  699    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3376  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  97.67 
 
 		 426 aa  839    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  86.58 
 
 		 429 aa  733    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.94 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4954  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.93 
 
 		 420 aa  349  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.0290114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  45.77 
 
 		 415 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4201  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.24 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  45.5 
 
 		 415 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1543  cytochrome c, class I  44.59 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0303209  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4418  cytochrome c, class I  44.71 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3948  cytochrome c, class I  44.71 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.69 
 
 		 403 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3851  cytochrome c, class I  44.33 
 
 		 420 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.585006  normal  0.540211 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4312  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.56 
 
 		 420 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1632  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.29 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5887  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.74 
 
 		 419 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.526257  normal  0.403041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3798  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.89 
 
 		 403 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1417  cytochrome c, class I  43.54 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00268752  normal  0.0511274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1907  cytochrome c, class I  41.83 
 
 		 411 aa  322  5e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.551897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05464  cytochrome c  36.71 
 
 		 718 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4016  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.52 
 
 		 411 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0979655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.99 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.69 
 
 		 680 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  41.44 
 
 		 708 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  38.94 
 
 		 675 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  38.02 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.02 
 
 		 723 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  39.64 
 
 		 675 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  40.25 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.34 
 
 		 434 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  39.34 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.66 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  39.34 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.07 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.44 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  38.61 
 
 		 439 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 430 aa  279  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  40.72 
 
 		 437 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  38.69 
 
 		 712 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.46 
 
 		 426 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  40.25 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  38.42 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  38.94 
 
 		 728 aa  277  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.12 
 
 		 426 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 441 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  37.71 
 
 		 439 aa  275  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.05 
 
 		 689 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  38.93 
 
 		 439 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.16 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.17 
 
 		 415 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.19 
 
 		 531 aa  273  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  38.58 
 
 		 415 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  36.5 
 
 		 421 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 691 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  38.18 
 
 		 721 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  36.58 
 
 		 698 aa  270  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  37.02 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.64 
 
 		 469 aa  269  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  38.67 
 
 		 721 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.46 
 
 		 1191 aa  269  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  36.86 
 
 		 450 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.52 
 
 		 447 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  38.1 
 
 		 773 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 463 aa  269  7e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  37.2 
 
 		 694 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.68 
 
 		 531 aa  269  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.13 
 
 		 475 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  36.13 
 
 		 475 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  36.13 
 
 		 475 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  36.13 
 
 		 477 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.95 
 
 		 477 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  37.28 
 
 		 669 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.93 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  35.22 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.34 
 
 		 422 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.47 
 
 		 726 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  36.25 
 
 		 430 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.48 
 
 		 424 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.31 
 
 		 432 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  36.53 
 
 		 430 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  36.53 
 
 		 430 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.91 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  35.31 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  35.31 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  35.31 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  35.31 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  35.31 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  35.31 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  35.31 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.66 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.8 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  39.12 
 
 		 1181 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  36.8 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  36.8 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  35.55 
 
 		 424 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>