More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1243 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 424 aa  860    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  98.58 
 
 		 424 aa  849    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  63.52 
 
 		 440 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  56.16 
 
 		 428 aa  475  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  53.63 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  57.04 
 
 		 427 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  54.05 
 
 		 429 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  55.92 
 
 		 425 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  56.14 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  56.13 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  51.97 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  51.97 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  52.76 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  51.4 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  49.74 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  49.74 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  49.74 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  50.12 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  50.26 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  52.2 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  49.74 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  49.74 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  49.74 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  49.74 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  51.44 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.48 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  50.79 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.21 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  48.68 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.47 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  48.68 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  48.95 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.68 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  46.35 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  57.29 
 
 		 447 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  48.68 
 
 		 432 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.42 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  48.95 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.95 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.1 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.13 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  41.3 
 
 		 407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  46.27 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  42.05 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  44.36 
 
 		 712 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  40.98 
 
 		 434 aa  310  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 433 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.05 
 
 		 448 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  42.19 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  43.37 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  38.77 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  43.37 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  44.65 
 
 		 691 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  41.77 
 
 		 698 aa  302  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  42.78 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.15 
 
 		 531 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.05 
 
 		 440 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.47 
 
 		 689 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  42.54 
 
 		 439 aa  296  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.83 
 
 		 426 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  40.99 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  38.88 
 
 		 708 aa  295  7e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.62 
 
 		 531 aa  296  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.88 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  40.8 
 
 		 721 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  40.8 
 
 		 694 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.39 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.11 
 
 		 531 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  41.58 
 
 		 675 aa  293  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.19 
 
 		 448 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.17 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  40.57 
 
 		 721 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.6 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.54 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.22 
 
 		 726 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.55 
 
 		 680 aa  289  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.09 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.53 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.59 
 
 		 434 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  37.67 
 
 		 728 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  40.87 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.27 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.81 
 
 		 538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.3 
 
 		 426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  39.33 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1632  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.71 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3798  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.44 
 
 		 403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.679754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.65 
 
 		 447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.56 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  41.69 
 
 		 675 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  40.82 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  40.56 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  40.56 
 
 		 475 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.9 
 
 		 451 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.18 
 
 		 415 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.05 
 
 		 477 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.71 
 
 		 403 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.71 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.9 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>