More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4075 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  90.43 
 
 		 461 aa  861    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  100 
 
 		 468 aa  971    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  83.42 
 
 		 461 aa  698    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.41 
 
 		 447 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  63.66 
 
 		 421 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  67.1 
 
 		 430 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  65.99 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  66.84 
 
 		 430 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  66.84 
 
 		 430 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  62.35 
 
 		 419 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  64.42 
 
 		 432 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  64.42 
 
 		 432 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  64.42 
 
 		 432 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  64.42 
 
 		 432 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  64.42 
 
 		 432 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  64.42 
 
 		 432 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  62.56 
 
 		 432 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  64.42 
 
 		 432 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  64.42 
 
 		 432 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  62.06 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  63.64 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  63.64 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  63.64 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  64.68 
 
 		 432 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  63.9 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  62.86 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  62.86 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  63.64 
 
 		 432 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  48.01 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  46.23 
 
 		 429 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.81 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  46.05 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0755  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor  51.04 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.819139  normal  0.030808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  47.63 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  48.42 
 
 		 440 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.68 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  48.54 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1719  cytochrome c, class I  49.08 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.98 
 
 		 425 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.9 
 
 		 447 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.6 
 
 		 444 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  43.49 
 
 		 407 aa  316  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  43.1 
 
 		 433 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.16 
 
 		 531 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  42.86 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.14 
 
 		 474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.73 
 
 		 417 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.9 
 
 		 538 aa  306  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  42.28 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  43.86 
 
 		 391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.47 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  42.6 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.63 
 
 		 531 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  43.48 
 
 		 415 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.54 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.6 
 
 		 448 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33640  dehydrogenase cytochrome c subunit  41.99 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  39.96 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.84 
 
 		 531 aa  296  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.12 
 
 		 422 aa  296  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  39.65 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  40.78 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.7 
 
 		 575 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  37.83 
 
 		 469 aa  293  7e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.15 
 
 		 439 aa  292  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.71 
 
 		 680 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.55 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  40.28 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  38.05 
 
 		 463 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.3 
 
 		 537 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  38.93 
 
 		 430 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.67 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.48 
 
 		 530 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  40.2 
 
 		 712 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.9 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39 
 
 		 454 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.27 
 
 		 689 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.07 
 
 		 432 aa  283  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.7 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  39.9 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  41.58 
 
 		 554 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.16 
 
 		 451 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.56 
 
 		 448 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.99 
 
 		 470 aa  281  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.13 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  41.16 
 
 		 527 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  41.16 
 
 		 527 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.95 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.51 
 
 		 469 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.25 
 
 		 475 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 475 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 475 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  38.35 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.2 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.05 
 
 		 447 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.71 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  38.87 
 
 		 438 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>