More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1453 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  100 
 
 
432 aa  881    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  72.59 
 
 
438 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.14 
 
 
434 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.51 
 
 
441 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.5 
 
 
422 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  51.51 
 
 
439 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  50.5 
 
 
432 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  51.15 
 
 
432 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  49.11 
 
 
430 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  51.15 
 
 
432 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.15 
 
 
432 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.52 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  50.51 
 
 
434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50 
 
 
434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  50.51 
 
 
434 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  50 
 
 
434 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  48.49 
 
 
433 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.37 
 
 
454 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.93 
 
 
447 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.93 
 
 
447 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.28 
 
 
415 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.31 
 
 
426 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.7 
 
 
417 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.48 
 
 
453 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  48.09 
 
 
415 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  47.45 
 
 
417 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  46.88 
 
 
450 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  46.85 
 
 
669 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  50 
 
 
439 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.79 
 
 
448 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  47.55 
 
 
439 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  47.49 
 
 
470 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.95 
 
 
451 aa  375  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  47.74 
 
 
475 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  49.87 
 
 
439 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.74 
 
 
475 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  47.74 
 
 
475 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  46.77 
 
 
477 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.88 
 
 
448 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  44.7 
 
 
698 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.85 
 
 
477 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.61 
 
 
469 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.56 
 
 
448 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.3 
 
 
439 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  43.78 
 
 
773 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.47 
 
 
448 aa  359  5e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  45.69 
 
 
728 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  46.42 
 
 
712 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  46.62 
 
 
463 aa  353  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.55 
 
 
395 aa  352  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  44.58 
 
 
450 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  44.89 
 
 
675 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  44.18 
 
 
675 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  44.31 
 
 
447 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.67 
 
 
689 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.41 
 
 
447 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  45.61 
 
 
694 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  45.61 
 
 
721 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.45 
 
 
470 aa  346  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  45.61 
 
 
721 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  44.42 
 
 
473 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  43.99 
 
 
476 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.41 
 
 
433 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.07 
 
 
440 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.08 
 
 
467 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  44.42 
 
 
509 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.61 
 
 
699 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  43.17 
 
 
708 aa  331  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  42.04 
 
 
469 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  44.3 
 
 
650 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  44.3 
 
 
476 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  44.3 
 
 
482 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.63 
 
 
726 aa  328  9e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  43.44 
 
 
691 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.19 
 
 
537 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.91 
 
 
451 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.11 
 
 
427 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  44.68 
 
 
527 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  44.68 
 
 
527 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.39 
 
 
427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.64 
 
 
527 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  44.27 
 
 
554 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.84 
 
 
444 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.9 
 
 
530 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.05 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  42.96 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  40.9 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.65 
 
 
425 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  41.65 
 
 
425 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  41.65 
 
 
425 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  41.41 
 
 
425 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.8 
 
 
425 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  40.57 
 
 
425 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  40.94 
 
 
425 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  41.96 
 
 
452 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  41.96 
 
 
452 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  41.46 
 
 
497 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.46 
 
 
432 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  40.25 
 
 
429 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  40.05 
 
 
421 aa  293  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>