299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6358 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5818  cytochrome c, class I  85.78 
 
 		 426 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5601  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  86.21 
 
 		 426 aa  764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4958  cytochrome c, class I  78.27 
 
 		 424 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.134188 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6358  cytochrome c, class I  100 
 
 		 428 aa  871    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0883371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1470  cytochrome c, class I  100 
 
 		 428 aa  871    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212518  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7024  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  99.07 
 
 		 428 aa  863    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263193  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5504  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  72.79 
 
 		 425 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326388  normal  0.134115 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5705  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  74.48 
 
 		 433 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3583  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding protein  48.36 
 
 		 1187 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  48.24 
 
 		 1191 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3948  aldehyde dehydrogenase family protein, putative/cytochrome c family protein, putative  48.36 
 
 		 1187 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.564465 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2135  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  47.65 
 
 		 1187 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.270413 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1889  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  47.89 
 
 		 1187 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2517  cytochrome c, class I  49.53 
 
 		 976 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.931319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2448  cytochrome c, class I  48.12 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  48.84 
 
 		 1182 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  47.43 
 
 		 1202 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2423  putative isoquinoline 1-oxidoreductase  47.37 
 
 		 1181 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  49.51 
 
 		 1183 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.62 
 
 		 1207 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3369  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.65 
 
 		 432 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  44.01 
 
 		 467 aa  359  5e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43810  putative cytochrome c  44.52 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4545  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.32 
 
 		 831 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4322  cytochrome c, class I  48.4 
 
 		 806 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4044  cytochrome c, class I  48.4 
 
 		 806 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.489703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3674  putative cytochrome c  44.19 
 
 		 433 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4058  isoquinoline 1-oxidoreductase  43.66 
 
 		 1215 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.222777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3481  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.41 
 
 		 795 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233456 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3088  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.26 
 
 		 442 aa  345  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.161961  normal  0.0270934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1183  cytochrome c, class I  45.05 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.03 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3929  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.23 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476483  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3925  cytochrome c, class I  44.88 
 
 		 975 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073446 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1855  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.66 
 
 		 996 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0190  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  44.64 
 
 		 1253 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1830  cytochrome c, class I  37.3 
 
 		 432 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0201  cytochrome c, class I  37.53 
 
 		 432 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6039  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.37 
 
 		 1179 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0887172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  39.22 
 
 		 425 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  40 
 
 		 425 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.48 
 
 		 425 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  40 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  40.65 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.89 
 
 		 474 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  40.35 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  40.35 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  40.35 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  40.35 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  40.35 
 
 		 452 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  40.1 
 
 		 452 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  40.95 
 
 		 497 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.56 
 
 		 425 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  38.56 
 
 		 425 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  38.56 
 
 		 425 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.13 
 
 		 432 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  37.63 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  40.75 
 
 		 492 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.19 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 421 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.37 
 
 		 447 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  37.63 
 
 		 432 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  38.81 
 
 		 501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.3 
 
 		 680 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.07 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.83 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  37.33 
 
 		 432 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  36.02 
 
 		 432 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.83 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  35.81 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  36.83 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  36.83 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39 
 
 		 436 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  39 
 
 		 436 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  39 
 
 		 436 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.1 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  37.1 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.3 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  36.3 
 
 		 468 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.66 
 
 		 531 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.98 
 
 		 426 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.02 
 
 		 432 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  36.06 
 
 		 415 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0986  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.22 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.69 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  37.14 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  39.49 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0858  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.5 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  38.2 
 
 		 430 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.83 
 
 		 461 aa  243  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0966  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  34.96 
 
 		 430 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.12 
 
 		 531 aa  242  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>