More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2085 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 432 aa  891    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  53.75 
 
 		 474 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49.37 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  49 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  49.12 
 
 		 425 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  49.12 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.65 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  48.99 
 
 		 425 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  48.74 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.74 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  48.74 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.99 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  48.3 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  48.5 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  48.25 
 
 		 452 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  48.25 
 
 		 497 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  48.25 
 
 		 492 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  48.25 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  48.25 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  48.25 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  48.25 
 
 		 452 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.26 
 
 		 427 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.39 
 
 		 427 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.97 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  47.24 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  45.01 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.55 
 
 		 436 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  45.55 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  45.55 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  44.33 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  44.79 
 
 		 501 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3373  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.1 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5692  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.1 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4612  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3756  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2479  cytochrome c family protein  42.46 
 
 		 407 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3802  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.95 
 
 		 455 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.503165 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  42.32 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  41.51 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4825  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.7 
 
 		 531 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605523 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1761  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.33 
 
 		 680 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.16 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.43 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  40.7 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.7 
 
 		 432 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5292  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.2 
 
 		 531 aa  292  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330766  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.35 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1130  putative cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  41.46 
 
 		 484 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.97 
 
 		 432 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  40.95 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  41.01 
 
 		 430 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  39.8 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.45 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  41.01 
 
 		 430 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3556  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.33 
 
 		 403 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.52 
 
 		 531 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.12 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  40.51 
 
 		 430 aa  285  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  40.69 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  40.69 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  40.69 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  40.69 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  40.69 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  40.69 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  40.69 
 
 		 432 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.85 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.52 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0016  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.1 
 
 		 420 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.331141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  40.45 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1781  cytochrome c, class I  39.95 
 
 		 451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0339245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.9 
 
 		 432 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  40.9 
 
 		 432 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  40.9 
 
 		 432 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.4 
 
 		 432 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  40.4 
 
 		 432 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  40.15 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.4 
 
 		 432 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  37.84 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2315  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  41.1 
 
 		 1191 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  39.8 
 
 		 424 aa  275  8e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.54 
 
 		 424 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.69 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  39.4 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  39.07 
 
 		 434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  40.34 
 
 		 415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1151  cytochrome c alcohol dehydrogenase subunit  39.47 
 
 		 451 aa  273  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  39.66 
 
 		 473 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61130  putative c-type cytochrome  39.85 
 
 		 415 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00213286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.44 
 
 		 415 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  37.16 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  39.1 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  37.73 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  40.2 
 
 		 1182 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.61 
 
 		 440 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  38 
 
 		 417 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1905  cytochrome c, class I  37.62 
 
 		 467 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331041  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4232  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  40.2 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>