More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0720 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0772  putative oxidoreductase dehydrogenase (cytochrome C subunit) signal peptide protein  82.62 
 
 		 429 aa  713    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456552  hitchhiker  0.00960965 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  96.96 
 
 		 427 aa  865    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0720  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 427 aa  887    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.690125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3977  cytochrome c, class I  67.08 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386742  normal  0.0120271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4441  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  67.08 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  65 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  64.49 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  64.95 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  65 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  65 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  66.41 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  64.57 
 
 		 492 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1350  glucose dehydrogenase, beta subunit  63.32 
 
 		 452 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0106089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1435  glucose dehydrogenase, beta subunit  63.57 
 
 		 452 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1244  cytochrome c family protein  63.07 
 
 		 452 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.148627  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1084  cytochrome c family protein  63.07 
 
 		 452 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2590  cytochrome c family protein  63.07 
 
 		 497 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0215  cytochrome c family protein  63.07 
 
 		 452 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0488  cytochrome c family protein  63.07 
 
 		 452 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2335  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  51.28 
 
 		 426 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5692  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  50.59 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0139384 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4612  cytochrome c, class I  50.35 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3756  cytochrome c, class I  50.35 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1159  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.7 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6817  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.5 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166846  normal  0.164997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1807  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.68 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000207286  hitchhiker  0.000745759 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7344  cytochrome c, class I  45.24 
 
 		 501 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.335201  normal  0.557089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  47.8 
 
 		 422 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.43 
 
 		 426 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3802  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.09 
 
 		 455 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.503165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  47.15 
 
 		 430 aa  349  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2085  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.03 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.35 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  45.41 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4265  cytochrome c, class I  44.03 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.105526  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.95 
 
 		 432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  44.95 
 
 		 432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  44.95 
 
 		 432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.26 
 
 		 434 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.05 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  44.61 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4216  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.91 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.42 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  44.26 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  44.26 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  43.43 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  45.05 
 
 		 417 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.62 
 
 		 451 aa  332  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  44.26 
 
 		 439 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2563  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  44.42 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151427 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.78 
 
 		 441 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.27 
 
 		 448 aa  328  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.85 
 
 		 439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0689  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  45.52 
 
 		 447 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  44.85 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3842  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.46 
 
 		 436 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  42.73 
 
 		 433 aa  323  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  42.31 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  42.82 
 
 		 439 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  42.26 
 
 		 447 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.53 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  44.53 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  44.53 
 
 		 475 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  42.65 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  44.67 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.77 
 
 		 447 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  43.25 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  42 
 
 		 675 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.39 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.73 
 
 		 689 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  44.03 
 
 		 470 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  42.5 
 
 		 669 aa  316  6e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  41.83 
 
 		 453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  42.03 
 
 		 675 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.18 
 
 		 440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.03 
 
 		 469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  42 
 
 		 432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.32 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  43.46 
 
 		 448 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.75 
 
 		 395 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.24 
 
 		 451 aa  306  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0808  cytochrome c, class I  41.89 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.71514  normal  0.0769565 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.86 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4890  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.35 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5380  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 436 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2986  cytochrome c, class I  40.35 
 
 		 436 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  38.48 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 698 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  43.76 
 
 		 447 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 708 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.38 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  39.81 
 
 		 721 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  39.32 
 
 		 509 aa  295  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  41.69 
 
 		 712 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  39.57 
 
 		 721 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0226  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.58 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  39.57 
 
 		 694 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  41.42 
 
 		 476 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>