44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0606 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  100 
 
 
181 aa  364  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  85.28 
 
 
182 aa  279  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  87.74 
 
 
182 aa  276  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  85.71 
 
 
178 aa  269  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  83.93 
 
 
178 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  83.93 
 
 
178 aa  261  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  74.23 
 
 
183 aa  249  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  92.92 
 
 
113 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  46.03 
 
 
161 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  40 
 
 
156 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  37.19 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  36.44 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  40.87 
 
 
172 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  41.35 
 
 
157 aa  85.1  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  38.26 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  41.28 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  32.62 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  34.51 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  34.65 
 
 
232 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  35.48 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  30.32 
 
 
159 aa  61.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  36.89 
 
 
147 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  32.8 
 
 
150 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  35.51 
 
 
158 aa  58.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  32.17 
 
 
151 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  33.33 
 
 
152 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  32 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  35.54 
 
 
156 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  30.77 
 
 
146 aa  51.2  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  33.61 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  33.33 
 
 
166 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  33.33 
 
 
157 aa  47.8  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
166 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
166 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  32.38 
 
 
166 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  32.38 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  31.43 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  30.7 
 
 
166 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  27.83 
 
 
136 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  35.79 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  27.97 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  36.84 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  30.48 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  28.26 
 
 
407 aa  40.8  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>