37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0562 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  100 
 
 		 156 aa  320  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  58.73 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  50.76 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  40.28 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  40.82 
 
 		 182 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  39.04 
 
 		 182 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  42.02 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  45.95 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  40 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  41.44 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  41.44 
 
 		 178 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  40.57 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  45.26 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  37.59 
 
 		 183 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  41.44 
 
 		 181 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  43.27 
 
 		 113 aa  87.8  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  36.27 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  35.2 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  34.93 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  39.62 
 
 		 232 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  38.38 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  32.77 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  32.28 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  24.07 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  25.53 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  25.71 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  28.07 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  30.7 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  25.95 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  26.19 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  24.62 
 
 		 165 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 150 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  25.32 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  25.32 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  27.46 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>