45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5057 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  100 
 
 		 178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  93.82 
 
 		 178 aa  305  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  81.93 
 
 		 182 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  86.9 
 
 		 181 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  81.93 
 
 		 182 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  76.97 
 
 		 183 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  93.81 
 
 		 113 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  46.48 
 
 		 161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  41.73 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  38.03 
 
 		 157 aa  94  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  38.66 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  38.02 
 
 		 149 aa  91.3  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  37.16 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  38.26 
 
 		 157 aa  84.3  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  72  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  38.14 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  31.91 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  33.91 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  32.8 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  35.85 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  31.45 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  35.2 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  30.17 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  33.61 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  31.2 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  31.2 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  31.2 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  29.94 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  29.6 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  28.66 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  29.66 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  30.17 
 
 		 115 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  40 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  35.79 
 
 		 151 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 166 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  27.84 
 
 		 407 aa  40.8  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>