30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3250 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  46.67 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  41.51 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  45.95 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  44.44 
 
 		 149 aa  94  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  37.41 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  41.35 
 
 		 181 aa  84.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 178 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 178 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  37.4 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  39.42 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  42.27 
 
 		 113 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  39.37 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  33.62 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  37.74 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  34.91 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  37.06 
 
 		 232 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  30.91 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  33.96 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  29.05 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  28.57 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 		 385 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  29.59 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  28.32 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  27.27 
 
 		 161 aa  42  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1857  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  57.69 
 
 		 538 aa  41.2  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.413717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>