43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4467 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  95.05 
 
 		 182 aa  349  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  85.28 
 
 		 181 aa  258  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  93.85 
 
 		 178 aa  255  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  75.64 
 
 		 183 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  95.04 
 
 		 178 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  95.04 
 
 		 178 aa  240  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  92.04 
 
 		 113 aa  217  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  46.46 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  39.04 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  37.19 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  33.09 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  40.87 
 
 		 172 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  39.72 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  37.41 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  38.26 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  34.4 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  33.04 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  32.82 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  32.8 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  36.89 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  35.51 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  34.91 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  32 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  35.58 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  33.61 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  29.86 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  29.84 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  26.28 
 
 		 136 aa  48.9  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  32.38 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  32.38 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  35.87 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  45 
 
 		 153 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  30.69 
 
 		 166 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  30.3 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>