27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4367 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  58.14 
 
 		 157 aa  149  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  49.32 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 150 aa  97.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  42.19 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 182 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  37.04 
 
 		 182 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  37.29 
 
 		 183 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  37.19 
 
 		 178 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  39.55 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 178 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 178 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  37.84 
 
 		 181 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  40 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  39.64 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  39.09 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  44 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  38.32 
 
 		 168 aa  74.7  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  34.19 
 
 		 232 aa  67  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  34.69 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  39.25 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  34.86 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  32.11 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  28.57 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  26.85 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  31.62 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>