23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0038 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  100 
 
 		 166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  30.88 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  34.69 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  32.26 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  36.3 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  35.19 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  35.19 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  35.19 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  32.41 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  34.38 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  28.47 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  28.12 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  29.37 
 
 		 166 aa  43.9  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  26.35 
 
 		 151 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>