24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3822 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3822  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  320  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  46.67 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  40 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  41.3 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  39.72 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2220  hypothetical protein  40.52 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.785493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  41.28 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4075  cytochrome c, class I  37.06 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1690  cytochrome c, class I  45 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2652  hypothetical protein  39.66 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  39.45 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  42.2 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  42.2 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  42.45 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  44 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0156  cytochrome c, class I  35.66 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.417204  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  42 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2338  hypothetical protein  36.29 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0038  putative cytochrome c-552  34.69 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277554  normal  0.0180936 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  34.51 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  31.03 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  30.63 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 232 aa  45.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  30 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>