More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2872 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  100 
 
 		 159 aa  320  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  78.79 
 
 		 147 aa  216  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  75 
 
 		 146 aa  201  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  74.4 
 
 		 151 aa  192  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  59.83 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  51.68 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  53.68 
 
 		 232 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  46.09 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  40.46 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  42.06 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  39.17 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  39.66 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  42.86 
 
 		 202 aa  87.8  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  40.83 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  41.38 
 
 		 166 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  38.02 
 
 		 268 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  40.83 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  40.83 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  37.96 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  38.76 
 
 		 510 aa  84.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  38.76 
 
 		 499 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 197 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  38.76 
 
 		 499 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  37.61 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  35.88 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  43.48 
 
 		 516 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  37.19 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  36.94 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  39.32 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  38.41 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  41.86 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  42.72 
 
 		 516 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  35 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  42.72 
 
 		 520 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  44.12 
 
 		 577 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  42.72 
 
 		 520 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  43.96 
 
 		 520 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  43.96 
 
 		 520 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  43.96 
 
 		 520 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  43.96 
 
 		 520 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  44.86 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  35.9 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  37.32 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  38.74 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.58 
 
 		 601 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  44.58 
 
 		 479 aa  70.9  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  38.83 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  42.53 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  41.75 
 
 		 481 aa  68.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  35.65 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  40.45 
 
 		 675 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  33.33 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  37.29 
 
 		 712 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  37.62 
 
 		 728 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.52 
 
 		 1068 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  34.95 
 
 		 773 aa  64.3  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  39.08 
 
 		 675 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4367  hypothetical protein  39.25 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  36 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.53 
 
 		 689 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  34.4 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.84 
 
 		 1055 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 669 aa  61.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0562  cytochrome c, class I  38.38 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  38.78 
 
 		 587 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.74 
 
 		 699 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  36.9 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3250  hypothetical protein  33.96 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  37.8 
 
 		 721 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  32.17 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0652  cytochrome c family protein  39.02 
 
 		 509 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  37.8 
 
 		 694 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  37.8 
 
 		 721 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  36.17 
 
 		 338 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  32.17 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  33.33 
 
 		 335 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 762 aa  58.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  32.17 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  31.86 
 
 		 698 aa  58.2  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  32.17 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.64 
 
 		 726 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  37.21 
 
 		 691 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  33.64 
 
 		 331 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  32.17 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  32.17 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  36.59 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  30.17 
 
 		 140 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  40.54 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2870  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  35.79 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870199  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.64 
 
 		 531 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  31.93 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.54 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  38.24 
 
 		 405 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  30.83 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  30.25 
 
 		 525 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  39.22 
 
 		 521 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  30.25 
 
 		 517 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  35.19 
 
 		 708 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>