150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0561 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0561  cytochrome c class I  100 
 
 		 157 aa  313  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1689  cytochrome c, class I  66.14 
 
 		 152 aa  168  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4366  cytochrome c, class I  54.84 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  42.02 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  38.36 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 146 aa  90.9  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  35.04 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  43.36 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0037  cytochrome c class I  36.61 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.113855  normal  0.0169208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  41.18 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  41.6 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1565  cytochrome c class I  35.4 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  36.8 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4076  cytochrome c, class I  42.22 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  42.17 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  46.25 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  38.05 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  40.66 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  39.78 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  29.82 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  38.37 
 
 		 510 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  41.76 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  35.58 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3584  cytochrome c class I  33.61 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498131 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  33.57 
 
 		 499 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  35.59 
 
 		 516 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4468  cytochrome c, class I  33.63 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  33.57 
 
 		 499 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4993  cytochrome c class I  33.63 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0594408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0605  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  37.04 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3813  cytochrome c class I  30.97 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.683358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3309  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5058  cytochrome c, class I  32.74 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.81836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  37.04 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  37.04 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  37.04 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5226  cytochrome c class I  32.74 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.895227  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  35.38 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 		 577 aa  57.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  34.74 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  36.36 
 
 		 479 aa  57.4  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  33.83 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  36.59 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  36.11 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  36.19 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  36.11 
 
 		 520 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  36.11 
 
 		 516 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  36.13 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0431  cytochrome c class I  36.25 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.472304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4349  cytochrome c class I  31.16 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  29.79 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.93 
 
 		 601 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  32.11 
 
 		 335 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.62 
 
 		 1055 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  35.46 
 
 		 428 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  28.47 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.72 
 
 		 425 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  35.79 
 
 		 587 aa  51.2  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  32.77 
 
 		 338 aa  51.2  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0663  isoquinoline 1-oxidoreductase  33.33 
 
 		 1202 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4209  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.09 
 
 		 1182 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4992  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  39.82 
 
 		 350 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.18 
 
 		 447 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  34.74 
 
 		 214 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4467  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0606  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  34.45 
 
 		 427 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 669 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  31.96 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3310  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5057  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 178 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4095  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.07 
 
 		 425 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5227  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 178 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725952 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6548  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 425 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1294  cytochrome c, class I  36.22 
 
 		 425 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618448  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1414  cytochrome c family protein  37.82 
 
 		 492 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.186397  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.17 
 
 		 1068 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  24.77 
 
 		 407 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3814  cytochrome c class I  30 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4332  Isoquinoline 1-oxidoreductase., Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.23 
 
 		 1207 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.5 
 
 		 726 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  37.08 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.26 
 
 		 759 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  36.49 
 
 		 775 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 432 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 424 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.65 
 
 		 424 aa  44.7  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1669  pyrroloquinoline-quinone aldehyde dehydrogenase  32.67 
 
 		 1183 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3816  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 425 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4552  cytochrome c, class I  36.97 
 
 		 425 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.859169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5752  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.97 
 
 		 425 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.95358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2490  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.51 
 
 		 432 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 432 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  35.05 
 
 		 432 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3585  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 113 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.485186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>