More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4896 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  100 
 
 
142 aa  295  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  57.14 
 
 
149 aa  144  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  47.89 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  42.96 
 
 
161 aa  120  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  44.85 
 
 
577 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.49 
 
 
601 aa  111  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  41.88 
 
 
202 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  48.54 
 
 
587 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  43.16 
 
 
202 aa  97.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  41.58 
 
 
205 aa  97.1  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  45.26 
 
 
222 aa  96.3  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  44.55 
 
 
197 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  38.24 
 
 
499 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  38.24 
 
 
499 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  41.58 
 
 
479 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  36.27 
 
 
510 aa  87.8  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  38.24 
 
 
516 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  38.61 
 
 
520 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  38.61 
 
 
516 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  46.3 
 
 
1068 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  38.61 
 
 
520 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  42.31 
 
 
669 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  37.62 
 
 
520 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  37.62 
 
 
520 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  37.62 
 
 
520 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  37.62 
 
 
520 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  39.13 
 
 
548 aa  84.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  42.86 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  39.39 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  39.47 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  39.39 
 
 
202 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  46.3 
 
 
1055 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40 
 
 
773 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  43.48 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  43.3 
 
 
189 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.74 
 
 
852 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  39.68 
 
 
481 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  41.9 
 
 
251 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  40.18 
 
 
158 aa  78.2  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.51 
 
 
433 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2872  cytochrome c class I  44.86 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.45 
 
 
762 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  38.61 
 
 
268 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1925  cytochrome c class I  40 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.379147  hitchhiker  0.000000158454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.66 
 
 
699 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  37.74 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.38 
 
 
689 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  36.64 
 
 
429 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.94 
 
 
448 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.04 
 
 
759 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4638  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.05 
 
 
451 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.86 
 
 
439 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1601  cytochrome c, class I  43.75 
 
 
432 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.023048  normal  0.40449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2504  putative cytochrome c  39.81 
 
 
434 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  35.14 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  37.84 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  39.5 
 
 
473 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  32.76 
 
 
675 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4961  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.16 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360414  normal  0.0488597 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  38.1 
 
 
463 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4796  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.97 
 
 
440 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.160851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.86 
 
 
417 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  37.86 
 
 
417 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3292  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.33 
 
 
475 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.618986 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5193  cytochrome c, class I  42.61 
 
 
432 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1497  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.52 
 
 
448 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0777111  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5084  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.61 
 
 
432 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  35.92 
 
 
419 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  41.18 
 
 
469 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  37.25 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3175  cytochrome c, class I  42.61 
 
 
432 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4141  cytochrome c, class I  38.33 
 
 
475 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.5261  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4225  cytochrome c, class I  38.33 
 
 
475 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138651  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4408  cytochrome c, class I  41.74 
 
 
434 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  36.59 
 
 
428 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4121  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.14 
 
 
477 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  36 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3959  cytochrome c, class I  41.74 
 
 
434 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  37 
 
 
427 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3647  cytochrome c, class I  37.14 
 
 
477 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.946427  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5949  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  41.74 
 
 
434 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.275687  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3250  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.93 
 
 
422 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4297  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  42.72 
 
 
441 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.89 
 
 
415 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  36.19 
 
 
377 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  36.19 
 
 
377 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1689  cytochrome c, class I  41.18 
 
 
430 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0300798  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  34.25 
 
 
447 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3829  cytochrome c, class I  42.72 
 
 
439 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0398501  normal  0.201929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  37.86 
 
 
439 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  34.65 
 
 
675 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  34.04 
 
 
391 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1792  cytochrome c, class I  37.5 
 
 
470 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.346602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  37.25 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  33.07 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4380  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  38.33 
 
 
469 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.36 
 
 
749 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.25 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.07 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3011  Cytochrome-c oxidase  37.62 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.913445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>