More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4716 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  56.67 
 
 		 773 aa  838    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 759 aa  1570    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  56.45 
 
 		 762 aa  862    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.47 
 
 		 749 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.65 
 
 		 852 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  30.24 
 
 		 756 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.12 
 
 		 705 aa  205  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.01 
 
 		 1171 aa  180  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.64 
 
 		 712 aa  171  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.19 
 
 		 1180 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.09 
 
 		 1274 aa  165  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.87 
 
 		 1068 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.31 
 
 		 1265 aa  160  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.04 
 
 		 1162 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.44 
 
 		 1193 aa  127  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.12 
 
 		 1503 aa  124  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.72 
 
 		 1149 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.07 
 
 		 1055 aa  114  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.78 
 
 		 1181 aa  113  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.41 
 
 		 1286 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.2 
 
 		 1201 aa  105  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  24.75 
 
 		 1139 aa  103  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.36 
 
 		 1040 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.58 
 
 		 1027 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.26 
 
 		 868 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.75 
 
 		 1306 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.15 
 
 		 1084 aa  96.3  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  40.48 
 
 		 203 aa  95.5  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.96 
 
 		 957 aa  94.7  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.15 
 
 		 951 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.09 
 
 		 1023 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 202 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  39.84 
 
 		 189 aa  87.8  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  38.21 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.35 
 
 		 968 aa  84.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  36.13 
 
 		 202 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.18 
 
 		 1390 aa  81.3  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  35.4 
 
 		 147 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  37.3 
 
 		 205 aa  77  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  30.65 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  38.18 
 
 		 202 aa  76.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  39.81 
 
 		 587 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  28.57 
 
 		 499 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  28.57 
 
 		 499 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  35.78 
 
 		 479 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  31.19 
 
 		 149 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  33.88 
 
 		 577 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  36.04 
 
 		 142 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  34.51 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  34.38 
 
 		 136 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  33.62 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.04 
 
 		 601 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.7 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.64 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  36.04 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  39.09 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  27.93 
 
 		 516 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  32.73 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1453  cytochrome c, class I  36.72 
 
 		 432 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.45 
 
 		 527 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 145 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  32.79 
 
 		 161 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  28.44 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.63 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  28.44 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  36.61 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  28.44 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  29.84 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  28.44 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  28.44 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  28.44 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  29.55 
 
 		 139 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  28.44 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  34.55 
 
 		 527 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  32.31 
 
 		 158 aa  64.7  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  30.97 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  30.82 
 
 		 429 aa  63.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0943  cytochrome c family protein  32 
 
 		 650 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 537 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943544 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4096  putative cytochrome c  35.45 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0768  cytochrome c family protein  32 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0780  cytochrome c family protein  32 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00190536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1599  cytochrome c, class I  34.17 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35270  putative cytochrome c precursor  36.94 
 
 		 439 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.534785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2502  cytochrome c, class I  33.93 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6211  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.55 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  31.53 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  36 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  29.46 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  31.82 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  26.36 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.64 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1440  putative cytochrome c, class I  29.27 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  33.64 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  32.35 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  32.56 
 
 		 147 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  24.66 
 
 		 361 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  36.04 
 
 		 439 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>