188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1876 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  100 
 
 		 775 aa  1547    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12333  probable major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  36.45 
 
 		 150 aa  83.2  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.378293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1787  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  25.97 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  40.37 
 
 		 189 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4806  cytochrome c class I  34.38 
 
 		 136 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167135  normal  0.0495406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  41.05 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2870  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  24.78 
 
 		 334 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0870199  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  37.86 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  30.94 
 
 		 577 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  33.08 
 
 		 222 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  36.56 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.5 
 
 		 601 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  38.82 
 
 		 510 aa  72  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  34.86 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  34.86 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 516 aa  70.9  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5782  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  23.91 
 
 		 338 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00253495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  24.82 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  40 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  40 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  35.04 
 
 		 202 aa  68.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  40 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  40 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  40 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  40 
 
 		 516 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  40 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  32.71 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 139 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  33.6 
 
 		 202 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.65 
 
 		 773 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  36.36 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.19 
 
 		 1055 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  37.62 
 
 		 197 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5487  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.1 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2565  cytochrome c, class I  29.77 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938803  hitchhiker  0.00615552 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.89 
 
 		 762 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1243  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.77 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  37.62 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2187  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit precursor, cytochrome c553  33.62 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.51 
 
 		 429 aa  60.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.58 
 
 		 852 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0083  putative alcohol dehydrogenase cytochrome c subunit  31.53 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1519  nitrite reductase, copper-containing  32.41 
 
 		 481 aa  59.7  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0249  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767699  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0915  cytochrome C  29.01 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  35.05 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3387  cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.647099  normal  0.180039 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2697  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2380  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0736  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0749  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2461  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.82 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2014  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.684291  normal  0.0791101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0456  cytochrome c, class I  34.07 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.01 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  28.24 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  30.91 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.69 
 
 		 749 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8114  cytochrome c class I  28.23 
 
 		 419 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2030  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.33 
 
 		 433 aa  57  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0350  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.53 
 
 		 461 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0428  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.52 
 
 		 432 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20531  normal  0.416218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.08 
 
 		 1068 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2058  cytochrome c, class I  28.24 
 
 		 432 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37855  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2698  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.24 
 
 		 432 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  28.24 
 
 		 432 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3640  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.5 
 
 		 395 aa  55.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  30.7 
 
 		 548 aa  55.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.23 
 
 		 759 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 142 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4075  putative cytochrome c precursor  31.25 
 
 		 468 aa  55.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  0.598856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3169  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.96 
 
 		 494 aa  55.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0153486  hitchhiker  0.0000801233 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0608  cytochrome c family protein  29.09 
 
 		 432 aa  54.3  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  30.68 
 
 		 274 aa  54.3  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3927  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  27.92 
 
 		 214 aa  54.3  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  33.04 
 
 		 268 aa  54.3  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  31.82 
 
 		 429 aa  54.3  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2594  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.48 
 
 		 432 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3309  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.19 
 
 		 432 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1163  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.79 
 
 		 448 aa  53.9  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2722  cytochrome c, class I  27.48 
 
 		 432 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.272858  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1282  cytochrome c, class I  29.66 
 
 		 427 aa  53.9  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2094  cytochrome c, class I  32.2 
 
 		 429 aa  53.9  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.716571 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  32.1 
 
 		 721 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0084  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 433 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0625  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.08 
 
 		 461 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.956199  normal  0.273824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0650  putative periplasmic cytochrome c  23.18 
 
 		 432 aa  53.5  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524273  normal  0.460926 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0171  putative cytochrome c, class I  26.72 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  32.1 
 
 		 694 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1489  cytochrome C  29.03 
 
 		 430 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1400  cytochrome c, class I  28.91 
 
 		 421 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0263  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.32 
 
 		 470 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.473095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  28.74 
 
 		 150 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1350  cytochrome c family protein  29.03 
 
 		 430 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1356  cytochrome c family protein  29.03 
 
 		 430 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2138  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.19 
 
 		 439 aa  52.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.622417  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2877  cytochrome c family protein  30.28 
 
 		 430 aa  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00910  gluconate dehydrogenase cytochrome c subunit  28.08 
 
 		 439 aa  52  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.367446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>