46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0146 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  100 
 
 		 115 aa  233  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  56.04 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  61.18 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  46.3 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  42.48 
 
 		 124 aa  103  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  41.9 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  39.66 
 
 		 114 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  42.59 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  40.37 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  38.46 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  35.96 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.28 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  34.04 
 
 		 484 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  39.13 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  36.96 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  29.25 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  38.96 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  34.31 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4156  cytochrome c class I  27.62 
 
 		 158 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  33.64 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5240  putative cytochrome c class I protein  31.25 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.361505 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0260  monoheme cytochrome SoxX  32 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00749516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  32.99 
 
 		 327 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  38.16 
 
 		 232 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2764  putative cytochrome c, putative soxX protein  32.35 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  31.43 
 
 		 220 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  31.43 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 370 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  34.95 
 
 		 367 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0066  putative cytochrome c, putative SoxX protein  30.19 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1673  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.35 
 
 		 307 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.528501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  30.86 
 
 		 256 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0958  cytochrome c551/c552-like protein  29.55 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1157  hypothetical protein  29.41 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  33.33 
 
 		 213 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  31.13 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 384 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  28.24 
 
 		 245 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  28.24 
 
 		 247 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2807  cytochrome c  23.89 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.294735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1738  C-type cytochrome, putative  29.27 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00460785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2986  hypothetical protein  31.68 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.338294  normal  0.0850747 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  33.77 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  32.73 
 
 		 227 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>