28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0567 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  100 
 
 		 120 aa  249  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  56.76 
 
 		 121 aa  133  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  47.37 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  50 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  42.7 
 
 		 97 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  35.29 
 
 		 169 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  33.71 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  35.87 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.14 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  28.57 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1157  hypothetical protein  28.99 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3918  hypothetical protein  30.49 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.32539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  31.87 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  33.75 
 
 		 245 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  33.75 
 
 		 247 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  32.97 
 
 		 213 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4150  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  31.25 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  28.09 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  34.74 
 
 		 210 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  34.38 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>