36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3450 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  57.74 
 
 		 187 aa  223  9e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  47.37 
 
 		 191 aa  174  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  46.67 
 
 		 190 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  40.57 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  41.34 
 
 		 210 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  41.9 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  43.11 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  41.04 
 
 		 220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  41.04 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  41.9 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  39.11 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  41.18 
 
 		 247 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  39.31 
 
 		 220 aa  124  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  39.47 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  37.5 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  39.13 
 
 		 236 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  39.2 
 
 		 233 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  37.25 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  36.08 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  35.23 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  35.71 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  31.9 
 
 		 218 aa  94.4  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  35.8 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  32.1 
 
 		 229 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  32.97 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  34.88 
 
 		 115 aa  51.2  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.34 
 
 		 121 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  33.72 
 
 		 115 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  35.24 
 
 		 367 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  33.06 
 
 		 370 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4808  putative di-heme cytochrome c peroxidase  42.22 
 
 		 455 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0518  sulfur oxidation protein SoxX  31.13 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00404971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>