40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2860 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  68.67 
 
 		 190 aa  239  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  59.04 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  47.59 
 
 		 184 aa  181  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  39.11 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  42.38 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  42.31 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  42.31 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  43.33 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  42.95 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  40.13 
 
 		 224 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  37.99 
 
 		 220 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  42.67 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  34.08 
 
 		 215 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  36.84 
 
 		 245 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  32.43 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  32.84 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  37.02 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  37.04 
 
 		 229 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  37.93 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  38.85 
 
 		 212 aa  96.3  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  30.22 
 
 		 256 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  34.15 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  30.85 
 
 		 218 aa  88.6  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  35.5 
 
 		 236 aa  88.2  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  34.81 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  40.16 
 
 		 212 aa  85.9  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  32.52 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 115 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  36.36 
 
 		 115 aa  52  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  34.21 
 
 		 115 aa  48.5  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  32.94 
 
 		 114 aa  48.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  31.36 
 
 		 484 aa  47.8  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  34.57 
 
 		 123 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 126 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  31.17 
 
 		 124 aa  45.1  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3763  cytochrome c class I  32.08 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0518  sulfur oxidation protein SoxX  28.85 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00404971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  32.05 
 
 		 97 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.84 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>