45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3452 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  100 
 
 		 190 aa  397  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  65.96 
 
 		 191 aa  244  8e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  53.94 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  45.16 
 
 		 184 aa  167  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  43.05 
 
 		 233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  38.55 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  46.45 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  45.81 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  45.81 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  40.96 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  38.62 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  36.47 
 
 		 215 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  39.18 
 
 		 220 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  43.33 
 
 		 220 aa  97.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  37.67 
 
 		 247 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  39.33 
 
 		 224 aa  94.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  37.5 
 
 		 229 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  38.06 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  39.24 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  37.18 
 
 		 236 aa  85.1  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  30.61 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  32.41 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  36.54 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  30.24 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  35.11 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  36.64 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  33.99 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  34.34 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  33.6 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  36.96 
 
 		 115 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  33.72 
 
 		 115 aa  52.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  36.84 
 
 		 115 aa  51.6  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  34.34 
 
 		 123 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  31.73 
 
 		 144 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  32.56 
 
 		 114 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 126 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  33.75 
 
 		 97 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  32.67 
 
 		 370 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0518  sulfur oxidation protein SoxX  27.88 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00404971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  30.77 
 
 		 150 aa  44.7  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  32.04 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  36.27 
 
 		 367 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  29.87 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  32.32 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0260  monoheme cytochrome SoxX  26.4 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00749516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>